why study proteins
play

Why study proteins ? - PDF document

Why study proteins ? -


  1. Why study proteins ? ����������������������������� • -��������������������������������� �������������������������������� � �������������*��������* ������������������� • +��.���/�����������������0��*���� ������������������*����������������� ����� �������.������������0���������*� ������������� �0��������������0������� #12���*����*� ��� ��� => ������0������������������������0��* ���� ��3�( ������������������������������������� ���������)��������������0���������� . ������( ��������������������������������������������������� !"#����$%&'( $��)��*��� +���*�,!! #���������*�������������� Why study protein loops? 6��&%��.�������.5� �������������������� /� • +�������*�������������������4�*����*� (Pauling, 1951) • =���������������5 1 &���������*�������5�*��������*� ##�(/� • =����������������������*�����������������*������� 6����1 α ����*0���1 β #������������������������5 +������������0<�5* 1 ����* /�������������0��##�� ���0���*�����78�( • ����*�9���*��)����.���������*�����������*/� V *�������:*��������� (Benner, 1998) 9;������������������������������ B �������� • ����*/�������������������������������� (Fernandez, 2004) Camproux et al., 2004 #�������������0�.����������� Method #�����������������*����*����8�.�/��-> #������������8�.�/�4- • #5*������������5*�*���� ����1<���* @ @�������*�9�%� 12 �12#$%�&#�343455555 !" #$%�&# ��*����*( (Sander & al., 2006) 555536'( �17 %%��4534 �" '( ����� 555555555'(#�� 1#,#�#��- �������� )" %%�� 4555555553'( 12 18& 1 ���������� *" '(#� 6��&% /�'(0#%-&01�70�%6455555 • ���������������)��1�����*������ ����1<���* @ /� +" ,#�#��- 55555555555',0#�6&2 �1� �" '( [ ] 19%�&#453434555555555 ( ) ( ) N w − E N w ." /�'(0#%- ( ) 5'(0#��&112 1#�#&/4345: 1 C*�����/ = Z w [ ] ( ) V N w -��� 1��������������� ���D�)��������(/� = � Np ������������ /�4?�7@@�����*� [ ] ( ) ( ) ( ) E N w L − k + 1 × µ w i • ������������0��6��&%�*���� 44?&����������0���* i = 1 A?3B�*���������������5 #���<���* /�#����� "����E�����&33@( �����>��#� ��.�����������&33?( • ��*���.���.5��8�*���������� ������* �

  2. ����1<���* @ ���������� -��*��������������1<���* @ ���*�H • &@'34�����1<���* @� F�'�����*( ��#��9�������������*������.��<����&���������*� � α (� • 3)��1�����*�������8&7�����1<���* @ ��������5��*������*��� *������������������5�A��J( • G)��1�����*����������" <(;�?3�����*/�4'�����1<���* @ �)����� ��� ��� 9;��%B��������* ��������������*����������0�*������1<���* @ ��#� ����� 3�?'L3��J 3�@3J 3�%%J ��#� ����� &�'%L3�8J 3�@@J @�%�J HBDS HVDS YBDS YZDS ZCDS BCDS GFFQ PZCD UFQK BDSK CDSK KHBZ ��#- ����� 9�&�@@J PBQP (653) (184) (164 ) (199) (506) (174) (239) (393) (181) (175) (158) (174) (216) IC-#/�3�@3J +K+�/�3�%�J QPBQ QKHB: BQGI: BQKH: BQLH: DSKG DSLH (232) DSKH DSKK DSKP: DSGI DSPI (248) (195) (209) (162) (204) (183) (153) (276) (234) (233) (322) ��#- ����� 9�&�7@J ��#- ����� 9���?8J PQPB SKGI SLGI PBBQ PBVQ HBBE HBZE HBBQ HBVQ BBQK BBQP -#+!/�3�%4J (160) (177) (158) (307) (180) (154) (199) (379) (198) (189) (231) -��*��������������1<���* @� ���*�H� Amino acid dependence 4'������<���*@����*��������*�����0����#� ����� ���������������������/�N���.��D1���.�����*5����������*���� N��( N���.��D��������.������7?�( ,�('����� I�-# 6�-# -#N6� ��#- ����� 9�G�?J ' % " ' % % N�� " , # 2��������5���!�9�77�%B ! "������ M�����**����������������� 6���0��*���E�������77@( 9�<����<��0���� �)������<��0�����������������.5��������1���� =��0*�E�����&33?( #! #� #) #* #+ #� #. #! #� #) #* #+ #� #. #! #� #) #* #+ #� #. Type loop dependence Preliminary conclusion (Wojcik & al, 1999; Mönnigman & Floudas, 2005) • =���D���������������������/�4?�����1<���* @ • �#�/������*����������������������������������*�������� =���D���������������������� ββ ββ ββ ββ �33 • !�������������������������������1<���*@��������* 83 βα βα βα βα '3 1 #��������� @3 αβ αβ αβ αβ 1 M��0�������D�������������������������0� &3 ���������� 3 αα αα αα αα ��� ��'( ���- ��3& '(0� '(00 ��&0 1 �����������*������������������ 1 ��)�������*�.�����*����<������* (Rhol & al., 2004) ����������;�7������* #0���������O 7������* ?�<���* &%�<���* • �����0����������������/�4&�����1<���* @ • �����������������*�����/� (Panchenko & Madej, 2005) &

Download Presentation
Download Policy: The content available on the website is offered to you 'AS IS' for your personal information and use only. It cannot be commercialized, licensed, or distributed on other websites without prior consent from the author. To download a presentation, simply click this link. If you encounter any difficulties during the download process, it's possible that the publisher has removed the file from their server.

Recommend


More recommend