Chem 204 1. Exam logis3cs 2. So7 ma8er Exam I - - PowerPoint PPT Presentation

Chem ¡204 ¡

• 1. Exam ¡logis3cs ¡
• 2. “So7 ¡ma8er” ¡

Exam ¡I ¡

• 7:00-­‑9:00 ¡pm ¡THURSDAY ¡Feb ¡13 ¡
• Bring ¡your ¡ID, ¡pen/pencil, ¡calculator ¡
• No ¡hint ¡sheets, ¡laptops, ¡cell ¡phone ¡usage ¡
• Sec3ons ¡AQA, ¡B, ¡G, ¡E, ¡I(Anustup, ¡Courtney): ¡

114 ¡David ¡Kinley ¡Hall ¡

• Sec3ons ¡AQC, ¡L, ¡M ¡(Nicole): ¡112 ¡Chem ¡Annex ¡
• Sec3ons ¡AQF, ¡D, ¡H ¡(Drish3): ¡66 ¡Library ¡
• Conflict ¡Exam: ¡4:30-­‑6:30 ¡pm, ¡161 ¡Noyes ¡Lab ¡

So7 ¡Ma8er ¡

• Micelles ¡
• Liquid ¡Crystals ¡
• The ¡Cell ¡Membrane ¡
• Polymers ¡

Micelles ¡

h8p://cronodon.com/BioTech/ Lipids.html ¡

About ¡20-­‑200 ¡molecules ¡ per ¡micelle, ¡ ¡ depending ¡on ¡compound ¡

Molecules ¡that ¡can ¡form ¡micelles ¡in ¡ water ¡(“surfactants” ¡“detergents”) ¡

SDS, ¡sodium ¡ dodecylsulfate ¡ Dioctyl ¡ sulfosuccinate, ¡ sodium ¡salt ¡ ¡ (aka ¡sodium ¡AOT) ¡ Cetyltrimethylammonium ¡ bromide ¡ (CTAB) ¡

Not ¡all ¡micelle-­‑forming ¡compounds ¡ have ¡to ¡be ¡ionic ¡

Highlights: ¡ Tween ¡20 ¡– ¡a ¡popular ¡nonionic ¡detergent ¡for ¡use ¡in ¡immunoassay ¡ wash ¡buffers ¡ Accurate ¡– ¡precise ¡10% ¡detergent ¡solu3on ¡in ¡ultrapure ¡water ¡ Easy-­‑to-­‑use ¡– ¡solu3on ¡is ¡simple ¡to ¡dispense ¡and ¡dilute ¡for ¡use ¡ Excep;onally ¡pure ¡– ¡less ¡than ¡1.0µeq/mL ¡peroxides ¡and ¡carbonyls ¡

¡ h8p://www.piercenet.com/product/tween-­‑20-­‑detergent-­‑solu3on ¡

Proper;es ¡of ¡Tween ¡20: ¡ Molecular ¡Weight: ¡1228g ¡ Detergent ¡Class: ¡Nonionic ¡ Aggrega3on ¡Number: ¡Unknown ¡ Micelle ¡Molecular ¡Weight: ¡Unknown ¡ Cri3cal ¡Micelle ¡Concentra3on ¡(CMC): ¡0.06mM ¡ (0.0074%, ¡w/v) ¡ Cloud ¡Point: ¡95°C ¡ Dialyzable: ¡No ¡ ¡

¡

Micelles ¡are ¡dynamic ¡

Micelle ¡forma3on ¡requires ¡a ¡cri3cal ¡ concentra3on ¡(“cmc”) ¡

h8p://employees.csbsju.edu/hjakubowski/classes/ch331/lipidstruct/ollipidwater.html ¡

Physical ¡proper3es ¡of ¡solu3on ¡change ¡when ¡you ¡cross ¡the ¡cmc! ¡

The ¡cmc ¡

CRITICAL ¡MICELLE ¡CONCENTRATION ¡ name ¡ ¡ ¡ ¡ ¡mM ¡ ¡mg/ml ¡MW ¡ ¡ n-­‑hepty ¡glucopyranoside ¡70 ¡ ¡19.5 ¡ ¡278 ¡ ¡ n-­‑octyl ¡glucopyranoside ¡ ¡23.2 ¡ ¡6.8 ¡ ¡292 ¡ ¡ n-­‑nonyl ¡glucopyranoside ¡ ¡6.5 ¡ ¡2.0 ¡ ¡306 ¡ ¡ n-­‑decyl ¡maltoside ¡ ¡ ¡2.19 ¡ ¡1.1 ¡ ¡499 ¡ ¡ n-­‑dodecyl ¡maltotrioside ¡ ¡0.2 ¡ ¡0.16 ¡ ¡825 ¡ ¡ Triton ¡X-­‑100 ¡ ¡ ¡ ¡0.24 ¡ ¡0.15 ¡ ¡625 ¡ ¡ Nonidet ¡P-­‑40 ¡ ¡ ¡ ¡ ¡0.29 ¡ ¡0.02 ¡ ¡603 ¡ ¡ Tween ¡20 ¡ ¡ ¡ ¡ ¡0.033 ¡0.04 ¡ ¡1364 ¡ ¡ Brij ¡98 ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡0.025 ¡0.04 ¡ ¡1527 ¡ ¡ sodium ¡deoxycholate ¡ ¡2-­‑6 ¡ ¡1.7 ¡ ¡415 ¡ ¡ sodium ¡taurocholate ¡ ¡10-­‑15 ¡6.7 ¡ ¡538 ¡ ¡ sodium ¡cholate ¡ ¡ ¡14 ¡ ¡6.0 ¡ ¡431 ¡ ¡ sodium ¡dodecyl ¡sulfate ¡ ¡8.3 ¡ ¡2.4 ¡ ¡289 ¡ ¡

What ¡proper3es ¡change ¡from ¡isolated, ¡ solvated ¡molecules ¡to ¡micelles? ¡

h8p://www.rsc.org/chemistryworld/issues/2003/march/inkchemistry.asp ¡

Ability ¡to ¡solvate ¡a ¡fluorescent ¡dye ¡

h8p://www.profoldin.com/detergent_cmc.html ¡

Here, ¡“signal” ¡= ¡fluorescence ¡intensity ¡from ¡a ¡ dye ¡that ¡does ¡not ¡emit ¡light ¡if ¡exposed ¡to ¡water, ¡ but ¡does ¡emit ¡light ¡if ¡protected ¡from ¡water. ¡ (A ¡proxy ¡for ¡grease ¡or ¡dirt!) ¡

Liquid ¡crystals ¡

• A ¡thermodynamically ¡stable ¡phase ¡
• 1D ¡or ¡2D ¡order: ¡ ¡not ¡a ¡solid, ¡not ¡a ¡liquid; ¡kind ¡
• f ¡goopy ¡

3D ¡order ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡2D ¡order ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡1D ¡order ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡0D ¡order ¡

Phase ¡Diagrams ¡

2D ¡(smec3c), ¡1D ¡(nema3c), ¡twisted ¡

h8p://www.laynetworks.com/Molecular-­‑Orienta3on-­‑in-­‑Liquid-­‑Crystal-­‑Phases.htm ¡

Bananas, ¡cones, ¡discs, ¡etc. ¡

FIGURE ¡1. ¡Liquid-­‑crystal ¡

• phases. ¡

From ¡the ¡following ¡ar3cle: ¡ Materials ¡chemistry: ¡Liquid ¡ crystals ¡stack ¡up ¡ Carsten ¡Tschierske ¡ Nature ¡419, ¡681-­‑683 ¡ (17 ¡October ¡2002) ¡ doi:10.1038/419681a ¡

~10% ¡of ¡organic ¡compounds ¡have ¡an ¡ LC ¡phase ¡

5-­‑cyano-­‑biphenyl ¡

Commercial ¡LC’s ¡

Liquid ¡crystals ¡have ¡cool ¡op3cal ¡ proper3es ¡

h8p://www.microscopyu.com/ar3cles/polarized/polarizedintro.html ¡

Liquid ¡crystals ¡have ¡cool ¡op3cal ¡proper3es; ¡plus ¡easy ¡to ¡align ¡the ¡ with ¡scratching ¡a ¡surface, ¡or ¡weak ¡electric ¡fields ¡

h8p://www.microscopyu.com/ar3cles/polarized/polarizedintro.html ¡

LCDs ¡(liquid ¡crystal ¡displays) ¡

Super-­‑fancy ¡LCDs ¡

A ¡Sharp ¡Triple-­‑direc;onal ¡viewing ¡LCD ¡panel. ¡ Depending ¡on ¡the ¡direc;on ¡from ¡which ¡you're ¡ viewing ¡it, ¡you ¡can ¡see ¡one ¡of ¡three ¡different ¡

• images. ¡(howstuffworks.com) ¡

Image ¡courtesy ¡Sharp ¡Corpora3on ¡

Lyotropic ¡liquid ¡crystals ¡

• In ¡a ¡lyotropic ¡liquid ¡crystal, ¡long-­‑range ¡1D/2D ¡
• rder ¡arises ¡from ¡a ¡solu3on ¡of ¡components, ¡

none ¡of ¡which ¡alone ¡necessarily ¡show ¡a ¡pure ¡ LC ¡phase ¡

Lyotropic ¡LCs ¡are ¡of ¡interest ¡to ¡Big ¡ Pharma ¡

h8p://www.par3clesciences.com/news/technical-­‑briefs/2012/cubic-­‑phase-­‑par3cles-­‑in-­‑drug-­‑delivery.html ¡

The ¡cell ¡membrane ¡= ¡a ¡lyotropic ¡LC ¡

Many ¡cell ¡membrane ¡components ¡are ¡ zwi8erions ¡(+ ¡and ¡-­‑) ¡

cholesterol ¡

Polymers ¡

Polymer ¡has ¡covalent ¡bonds ¡(usually ¡C-­‑C); ¡ Molecular ¡weight ¡not ¡precise; ¡ # ¡monomers ¡in ¡a ¡polymer ¡can ¡be ¡100-­‑10,000,000 ¡

Examples ¡of ¡polymers ¡

Examples ¡of ¡biodegradable ¡polymers ¡

Polymer ¡proper3es ¡depend ¡on ¡ solvent, ¡degree ¡of ¡crosslinking ¡

h8p://people.clarkson.edu/~sminko/nanostructured/responsive-­‑smart-­‑materials/s3muli-­‑responsive-­‑nanostructures.html ¡

Programmable ¡polymers ¡

Polymer ¡LCs ¡

Mesogen ¡= ¡liquid ¡crystal ¡molecule ¡ MC ¡= ¡main ¡chain ¡ SC ¡= ¡side ¡chain ¡

What ¡do ¡you ¡need ¡to ¡know? ¡

• Make ¡a ¡good ¡guess ¡if ¡a ¡molecule ¡will ¡form ¡a ¡

micelle ¡(we ¡just ¡saw ¡water, ¡but ¡same ¡logic ¡for ¡ nonpolar ¡solvents), ¡or ¡show ¡an ¡LC ¡phase ¡

• Defini3ons ¡and ¡proper3es ¡of ¡micelles, ¡cmc, ¡

liquid ¡crystals ¡

• Polymer ¡basics ¡