Life A'er a PhD; Landing a + + + Postdoc Posi5on - - PowerPoint PPT Presentation

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Life ¡A'er ¡a ¡PhD; ¡ Landing ¡a ¡ Postdoc ¡Posi5on ¡

Paul ¡Beck ¡ plbeck@ucalgary.ca ¡

The ¡Formula ¡That ¡Molded ¡Me! ¡

+ ¡ + ¡ + ¡ Queen’s ¡ BSc, ¡PhD ¡1980-­‑87 ¡

BeCer ¡at ¡hiding ¡a ¡beer ¡ for ¡pictures ¡than ¡Wally ¡ MacNaughton ¡

Gerry ¡Morris ¡ ¡ Queen’s ¡University ¡

• You ¡get ¡weird ¡ideas…. ¡I ¡like ¡

that! ¡

• I'm ¡not ¡sure ¡about ¡that ¡but ¡

spend ¡some ¡Vme ¡and ¡ explore ¡it! ¡

• Are ¡you ¡happy ¡or ¡not? ¡
• Be ¡good ¡to ¡yourself! ¡

Lets ¡make ¡a ¡be@er ¡model ¡of ¡coli5s ¡so ¡we ¡can ¡cure ¡IBD! ¡

15-­‑03-­‑31 ¡ 2 ¡

You ¡BeCer ¡Do ¡Something ¡Else ¡That ¡ Project ¡is ¡High ¡Risk! ¡

¡Wallace ¡JL, ¡Beck ¡PL, ¡Morris ¡GP. ¡A ¡role ¡for ¡leukotrienes ¡as ¡mediators ¡of ¡ ethanol-­‑induced ¡gastric ¡mucosal ¡damage? ¡Am ¡J ¡Physiol ¡1988; ¡254. ¡ ¡Wallace ¡JL, ¡Morris ¡GP, ¡Beck ¡PL, ¡Willamson ¡TE, ¡Gingras ¡GR. ¡Effects ¡of ¡ sucralfate ¡on ¡prostaglandin ¡and ¡leukotriene ¡synthesis: ¡rela5onship ¡to ¡ protec5ve ¡ac5ons. ¡Can ¡J ¡Physiol ¡Pharmacol ¡1988; ¡66. ¡ ¡ ¡Beck ¡PL, ¡Morris ¡GP, ¡Wallace ¡JL. ¡Reduc5on ¡of ¡ETOH-­‑induced ¡gastric ¡ mucosal ¡damage ¡by ¡sodium ¡cromoglycate ¡and ¡FPL-­‑52694. ¡The ¡role ¡of ¡ leukotrienes, ¡prostaglandins ¡and ¡mast ¡cells ¡in ¡the ¡protec5ve ¡mechanism. ¡ Can ¡J ¡Physiol ¡Pharmacol ¡1989; ¡67. ¡ ¡ ¡ ¡Wallace ¡JL, ¡MacNaughton ¡WK, ¡Morris ¡GP, ¡Beck ¡PL. ¡Inhibi5on ¡of ¡ leukotriene ¡synthesis ¡markedly ¡accelerates ¡healing ¡in ¡a ¡rat ¡model ¡of ¡ inflammatory ¡bowel ¡disease. ¡Gastroenterology ¡1989; ¡96. ¡ ¡ ¡

TNBS ¡Model ¡

• Hapten-­‑induced ¡model ¡of ¡chronic ¡

inflamma<on ¡and ¡ulcera<on ¡in ¡the ¡ rat ¡colon, ¡Gastroenterology, ¡1989. ¡

Morris ¡GP, ¡Beck ¡PL, ¡Herridge ¡MS, ¡Depew ¡WT, ¡ Szewczuk ¡MR, ¡Wallace ¡JL, ¡ ¡

• Transmural ¡inflammaVon ¡
• Granulomas ¡
• Altered ¡(immunocyte ¡populaVons) ¡
• Macrophage ¡dysfuncVon. ¡
• Later ¡found ¡to ¡be ¡a ¡Th1 ¡model ¡of ¡

coliVs ¡

Intes5nal ¡Homeostasis ¡is ¡a ¡product ¡of ¡the ¡ ability ¡of ¡5ssue ¡to ¡resist ¡injury ¡and ¡the ¡ability ¡ to ¡recover ¡from ¡injury ¡

• Barrier ¡funcVon ¡
• Immune ¡regulaVon ¡
• Blood ¡flow/endothelial ¡

funcVon ¡

• Repair ¡and ¡resVtuVon ¡
• Remodeling ¡and ¡

resoluVon ¡

• Bugs. ¡
• Which ¡cell ¡populaVons ¡

in ¡IBD ¡are ¡playing ¡the ¡ criVcal ¡role; ¡ – immune ¡cells ¡ ¡ – non-­‑immune ¡cells? ¡

Wouldn’t ¡it ¡be ¡cool! ¡

15-­‑03-­‑31 ¡ 3 ¡

Med ¡School, ¡Internal ¡Medicine, ¡GI ¡ ¡University ¡of ¡Calgary ¡87-­‑96 ¡

• Med ¡school-­‑PhD ¡juggle! ¡
• Basic ¡science ¡and ¡

translaVonal ¡research! ¡

(CHEST ¡2002; ¡121:647–649) ¡

Why ¡Not ¡Treat ¡HIV-­‑associated ¡ Lymphoma? ¡

• “NHL ¡in ¡HIV ¡is ¡a ¡

death ¡sentence” ¡

– Low ¡CD4 ¡counts, ¡many ¡infecVons ¡ – Predominantly ¡high ¡grade ¡ lymphomas ¡

• PaVents ¡were ¡not ¡offered ¡

therapy! ¡

• We ¡started ¡treaVng ¡NHL ¡in ¡HIV ¡

and ¡found ¡that ¡they ¡onen ¡ responded ¡well. ¡In ¡those ¡that ¡ were ¡treated ¡NHL ¡did ¡not ¡ markedly ¡impact ¡on ¡survival. ¡ ¡

– Can ¡J ¡Infect ¡Dis ¡1996; ¡7 ¡ – Am ¡J ¡Gastro1996; ¡91 ¡ – Can ¡J ¡Gastroent ¡2007;21 ¡ – Int ¡J ¡Surg ¡Pathol. ¡2007;15 ¡ – Journal ¡of ¡Cys<c ¡ ¡Fibrosis ¡2008;7 ¡ – Am ¡J ¡Gastroenterol. ¡2008 ¡Jul;103 ¡

What ¡are ¡the ¡Mechanisms ¡in ¡the ¡Pathogenesis ¡of ¡ Portal ¡Hypertensive ¡Gastropathy? ¡ ¡ Internal ¡Medicine, ¡GI ¡(1991-­‑96) ¡

• Those ¡with ¡PHG ¡

have ¡ ¡altered ¡blood ¡ flow, ¡decreased ¡ prostaglandins ¡and ¡ changes ¡in ¡nitric ¡

• xide ¡signaling. ¡
• Gastroenterology ¡1992;103 ¡
• Am ¡J ¡Physiol ¡1993;265 ¡
• Gastroenterology ¡1993;105 ¡ ¡
• Hepatol ¡1995; ¡23 ¡
• GUT ¡2001; ¡49 ¡
• Curr ¡Opin ¡ ¡Gastroenterol ¡

2003 ¡

15-­‑03-­‑31 ¡ 4 ¡

Swain ¡Studies ¡ Internal ¡Medicine-­‑GI ¡

• Hypothalamic ¡

pituitary ¡axis ¡is ¡ altered ¡in ¡cholestaVc ¡

• animals. ¡
• Am ¡J ¡Physiol ¡1997;272 ¡
• Hepatology ¡1998; ¡28 ¡
• J ¡Hepatol ¡2000;33 ¡
• GUT ¡2001; ¡49 ¡

Making ¡Plans ¡Early! ¡

• Know ¡where ¡you ¡need ¡to ¡get ¡to. ¡
• Know ¡the ¡routes/systems. ¡
• Know ¡your ¡compeVVon. ¡
• Know ¡the ¡Vme ¡lines. ¡
• Find ¡help, ¡make ¡contacts! ¡

“Pick ¡Dr ¡Podolsky ¡up ¡at ¡the ¡airport ¡ and ¡take ¡him ¡for ¡a ¡hike ¡before ¡the ¡ mee5ng” ¡

Seek ¡Out ¡Your ¡Mentors ¡and ¡Those ¡ That ¡You ¡Want ¡to ¡Train ¡With! ¡

How? ¡

• ConnecVons ¡
• MeeVngs ¡
• ArVcles ¡
• Colleagues ¡
• Mentors ¡

The ¡Screamer! ¡ The ¡Hugger! ¡

Be ¡an ¡acVve ¡mentee! ¡ ¡

Dan ¡Podolsky ¡ MassachuseCs's ¡General ¡Hospital ¡ 1996-­‑1999 ¡

“My ¡job ¡is ¡to ¡make ¡you ¡be@er ¡than ¡

• me. ¡ ¡So ¡either ¡you ¡have ¡to ¡be ¡

smarter ¡or ¡work ¡harder ¡or ¡both…… ¡I ¡ would ¡start ¡by ¡spending ¡more ¡5me ¡ in ¡the ¡lab!” ¡

15-­‑03-­‑31 ¡ 5 ¡

TGFβ ¡

differentiation

RegulaVon ¡of ¡IntesVnal ¡Homeostasis ¡ ¡

downregulation of inflammatory response

Luminal Factors Bacterial products

Apoptosis ¡

Time…. ¡the ¡only ¡non-­‑elasVc ¡variable ¡

• The ¡first ¡three ¡things ¡on ¡your ¡to ¡

do ¡list ¡have ¡to ¡be ¡about ¡ research! ¡

• ParVVoning ¡Vme! ¡
• Make ¡use ¡of ¡all ¡your ¡resources! ¡
• Quality ¡Vme ¡for ¡those ¡that ¡

count! ¡

• Educate ¡your ¡family. ¡

¡

Find ¡Your ¡Confidence… ¡

• No ¡one ¡is ¡perfect! ¡ ¡
• Only ¡one ¡worse ¡thing ¡

than ¡being ¡last ¡in ¡a ¡ race ¡is ¡not ¡running ¡it! ¡

• You ¡can ¡not ¡be ¡

everything ¡to ¡ everybody! ¡

• Think ¡about ¡the ¡

impact ¡of ¡where ¡you ¡ are ¡going! ¡

“If ¡you ¡can’t ¡excel ¡there ¡people ¡will ¡ think ¡you ¡won’t ¡be ¡able ¡to ¡excel ¡ anywhere” ¡

Think ¡About ¡Geqng ¡Your ¡First ¡Job ¡ Now! ¡

• What ¡does ¡it ¡take? ¡

– Papers ¡ – Awards ¡ – Experience ¡

• What ¡type ¡of ¡job? ¡

– Academic ¡

• Run ¡your ¡own ¡lab ¡
• Lab ¡associate ¡
• Teaching/Mentoring ¡

– Industry ¡

• Start ¡up? ¡
• Big ¡company? ¡
• Something ¡outside ¡the ¡box? ¡

Use ¡all ¡your ¡resources ¡for ¡informaVon ¡

15-­‑03-­‑31 ¡ 6 ¡

Paul ¡Applying ¡for ¡a ¡Job! ¡

• PhD; ¡6 ¡papers, ¡1 ¡book ¡chapter ¡
• Med ¡School/Part ¡Vme ¡Post-­‑doc; ¡14 ¡papers ¡
• Applying ¡for ¡CIHR/MRC; ¡17 ¡papers ¡ ¡
• Post-­‑Doc; ¡12 ¡main, ¡4 ¡others ¡
• Applying ¡for ¡Job; ¡

– ¡36 ¡published ¡or ¡in ¡press ¡ Simon, ¡PhD; ¡7 ¡papers, ¡Post-­‑Doc ¡3 ¡years ¡11 ¡papers ¡

1] ¡Effects ¡of ¡nitric ¡oxide ¡and ¡reacVve ¡oxygen ¡species ¡on ¡HIF-­‑1α ¡stabilizaVon ¡following ¡clostridium ¡difficile ¡toxin ¡exposure ¡of ¡the ¡Caco-­‑2 ¡epithelial ¡cell ¡line. ¡ ¡Lee ¡JY, ¡Hirota ¡SA, ¡Glover ¡LE, ¡Armstrong ¡GD, ¡Beck ¡PL, ¡MacDonald ¡JA. ¡Cell ¡Physiol ¡Biochem. ¡2013;32(2):417-­‑30. ¡ 2] ¡Intrarectal ¡insVllaVon ¡of ¡Clostridium ¡difficile ¡toxin ¡A ¡triggers ¡colonic ¡inflammaVon ¡and ¡Vssue ¡damage: ¡development ¡of ¡a ¡novel ¡and ¡efficient ¡mouse ¡model ¡of ¡ Clostridium ¡difficile ¡toxin ¡exposure. ¡Hirota ¡SA, ¡Iablokov ¡V, ¡Tulk ¡SE, ¡Schenck ¡LP, ¡Becker ¡H, ¡Nguyen ¡J, ¡Al ¡Bashir ¡S, ¡Dingle ¡TC, ¡Laing ¡A, ¡Liu ¡J, ¡Li ¡Y, ¡ Bolstad ¡J, ¡Mulvey ¡GL, ¡Armstrong ¡GD, ¡MacNaughton ¡WK, ¡Muruve ¡DA, ¡MacDonald ¡JA, ¡Beck ¡PL. ¡Infect ¡Immun. ¡2012 ¡Dec;80(12):4474-­‑84. ¡ ¡ 3] ¡The ¡Nlrp3 ¡inflammasome ¡promotes ¡myocardial ¡dysfuncVon ¡in ¡structural ¡cardiomyopathy ¡through ¡interleukin-­‑1β. ¡Bracey ¡NA, ¡Beck ¡PL, ¡Muruve ¡DA, ¡Hirota ¡SA, ¡ Guo ¡J, ¡Jabagi ¡H, ¡Wright ¡JR ¡Jr, ¡Macdonald ¡JA, ¡Lees-­‑Miller ¡JP, ¡Roach ¡D, ¡Semeniuk ¡LM, ¡Duff ¡HJ. ¡Exp ¡Physiol. ¡2013 ¡Feb;98(2):462-­‑72 ¡ 4] ¡AcVvaVon ¡of ¡neuronal ¡P2X7 ¡receptor-­‑pannexin-­‑1 ¡mediates ¡death ¡of ¡enteric ¡neurons ¡during ¡coliVs. ¡Gulbransen ¡BD, ¡BashashaV ¡M, ¡Hirota ¡SA, ¡Gui ¡X, ¡Roberts ¡JA, ¡ MacDonald ¡JA, ¡Muruve ¡DA, ¡McKay ¡DM, ¡Beck ¡PL, ¡Mawe ¡GM, ¡Thompson ¡RJ, ¡Sharkey ¡KA. ¡Nat ¡Med. ¡2012 ¡Mar ¡18;18(4):600-­‑4. ¡doi: ¡10.1038/nm.

• 2679. ¡

5] ¡The ¡airway ¡epithelium ¡nucleoVde-­‑binding ¡domain ¡and ¡leucine-­‑rich ¡repeat ¡protein ¡3 ¡inflammasome ¡is ¡acVvated ¡by ¡urban ¡parVculate ¡maCer. ¡Hirota ¡JA, ¡Hirota ¡ SA, ¡Warner ¡SM, ¡Stefanowicz ¡D, ¡Shaheen ¡F, ¡Beck ¡PL, ¡Macdonald ¡JA, ¡HackeC ¡TL, ¡Sin ¡DD, ¡Van ¡Eeden ¡S, ¡Knight ¡DA. ¡J ¡Allergy ¡Clin ¡Immunol. ¡2012 ¡Apr; 129(4):1116-­‑25. ¡ ¡ 6] ¡Intravascular ¡danger ¡signals ¡guide ¡neutrophils ¡to ¡sites ¡of ¡sterile ¡inflammaVon. ¡McDonald ¡B, ¡PiCman ¡K, ¡Menezes ¡GB, ¡Hirota ¡SA, ¡Slaba ¡I, ¡Waterhouse ¡CC, ¡Beck ¡ PL, ¡Muruve ¡DA, ¡Kubes ¡P. ¡Science. ¡2010 ¡Oct ¡15;330(6002):362-­‑6. ¡ ¡ 7] ¡NLRP3 ¡inflammasome ¡plays ¡a ¡key ¡role ¡in ¡the ¡regulaVon ¡of ¡intesVnal ¡homeostasis. ¡Hirota ¡SA, ¡Ng ¡J, ¡Lueng ¡A, ¡Khajah ¡M, ¡Parhar ¡K, ¡Li ¡Y, ¡Lam ¡V, ¡PotenVer ¡MS, ¡Ng ¡ K, ¡Bawa ¡M, ¡McCafferty ¡DM, ¡Rioux ¡KP, ¡Ghosh ¡S, ¡Xavier ¡RJ, ¡Colgan ¡SP, ¡Tschopp ¡J, ¡Muruve ¡D, ¡MacDonald ¡JA, ¡Beck ¡PL. ¡Inflamm ¡Bowel ¡Dis. ¡2011 ¡; 17(6):1359-­‑72. ¡ ¡ 8] ¡The ¡NLRP3 ¡inflammasome ¡promotes ¡renal ¡inflammaVon ¡and ¡contributes ¡to ¡CKD. ¡Vilaysane ¡A, ¡Chun ¡J, ¡Seamone ¡ME, ¡Wang ¡W, ¡Chin ¡R, ¡Hirota ¡S, ¡Li ¡Y, ¡Clark ¡SA, ¡ Tschopp ¡J, ¡Trpkov ¡K, ¡Hemmelgarn ¡BR, ¡Beck ¡PL, ¡Muruve ¡DA. ¡J ¡Am ¡Soc ¡Nephrol. ¡2010 ¡Oct;21(10):1732-­‑44 ¡ 9] ¡Clostridium ¡difficile ¡toxin-­‑induced ¡inflammaVon ¡and ¡intesVnal ¡injury ¡are ¡mediated ¡by ¡the ¡inflammasome. ¡Ng ¡J, ¡Hirota ¡SA, ¡Gross ¡O, ¡Li ¡Y, ¡Ulke-­‑Lemee ¡A, ¡ PotenVer ¡MS, ¡Schenck ¡LP, ¡Vilaysane ¡A, ¡Seamone ¡ME, ¡Feng ¡H, ¡Armstrong ¡GD, ¡Tschopp ¡J, ¡Macdonald ¡JA, ¡Muruve ¡DA, ¡Beck ¡PL. ¡Gastroenterology. ¡ 2010 ¡Aug;139(2):542-­‑52, ¡552. ¡ ¡ ¡ ¡ 10] ¡Hypoxia-­‑inducible ¡factor ¡signaling ¡provides ¡protecVon ¡in ¡Clostridium ¡difficile-­‑induced ¡intesVnal ¡injury. ¡ ¡Hirota ¡SA, ¡Fines ¡K, ¡Ng ¡J, ¡Traboulsi ¡D, ¡Lee ¡J, ¡Ihara ¡E, ¡Li ¡ Y, ¡Willmore ¡WG, ¡Chung ¡D, ¡Scully ¡MM, ¡Louie ¡T, ¡MedlicoC ¡S, ¡Lejeune ¡M, ¡Chadee ¡K, ¡Armstrong ¡G, ¡Colgan ¡SP, ¡Muruve ¡DA, ¡MacDonald ¡JA, ¡Beck ¡PL. ¡

• Gastroenterology. ¡2010 ¡Jul;139(1):259-­‑69 ¡ ¡

11] ¡TargeVng ¡hypoxia-­‑inducible ¡factor-­‑1 ¡(HIF-­‑1) ¡signaling ¡in ¡therapeuVcs: ¡implicaVons ¡for ¡the ¡treatment ¡of ¡inflammatory ¡bowel ¡disease. ¡ ¡Hirota ¡SA, ¡Beck ¡PL, ¡MacDonald ¡JA. ¡Recent ¡Pat ¡Inflamm ¡Allergy ¡Drug ¡Discov. ¡2009 ¡Jan;3(1):1-­‑16. ¡ ¡ 12] ¡Sodium ¡and ¡asthma: ¡something ¡borrowed, ¡something ¡new? ¡Hirota ¡SA, ¡Janssen ¡LJ. ¡Am ¡J ¡Physiol ¡Lung ¡Cell ¡Mol ¡Physiol. ¡2007 ¡Dec;293(6):L1369-­‑73. ¡ ¡ 13] ¡E-­‑Ring ¡Isoprostanes ¡SVmulate ¡a ¡Cl ¡Conductance ¡in ¡Airway ¡Epithelium ¡via ¡Prostaglandin ¡E2-­‑SelecVve ¡Prostanoid ¡Receptors. ¡Seto ¡V, ¡Hirota ¡C, ¡Hirota ¡S, ¡Janssen ¡

• LJ. ¡ ¡Am ¡J ¡Respir ¡Cell ¡Mol ¡Biol. ¡2008 ¡Jan;38(1):88-­‑94. ¡Epub ¡2007 ¡Aug ¡2. ¡ ¡

14] ¡The ¡reverse ¡mode ¡of ¡the ¡Na(+)/Ca(2+) ¡exchanger ¡provides ¡a ¡source ¡of ¡Ca(2+) ¡for ¡store ¡refilling ¡following ¡agonist-­‑induced ¡Ca(2+) ¡mobilizaVon. ¡ ¡Hirota ¡S, ¡Pertens ¡E, ¡Janssen ¡LJ. ¡ ¡Am ¡J ¡Physiol ¡Lung ¡Cell ¡Mol ¡Physiol. ¡2007 ¡Feb;292(2):L438-­‑47. ¡ ¡ ¡ 15] ¡Intracellular ¡Cl-­‑ ¡fluxes ¡play ¡a ¡novel ¡role ¡in ¡Ca2+ ¡handling ¡in ¡airway ¡smooth ¡muscle. ¡Hirota ¡S, ¡Trimble ¡N, ¡Pertens ¡E, ¡Janssen ¡LJ. ¡Am ¡J ¡Physiol ¡Lung ¡Cell ¡Mol ¡

• Physiol. ¡2006 ¡Jun;290(6):L1146-­‑53. ¡ ¡ ¡

16] ¡Airway ¡smooth ¡muscle ¡excitaVon-­‑contracVon ¡coupling ¡and ¡airway ¡hyperresponsiveness. ¡Hirota ¡S, ¡Helli ¡PB, ¡Catalli ¡A, ¡Chew ¡A, ¡Janssen ¡LJ. ¡Can ¡J ¡Physiol ¡

• Pharmacol. ¡2005 ¡Aug-­‑Sep;83(8-­‑9):725-­‑32. ¡Review. ¡ ¡ ¡

17] ¡Vascular ¡relaxaVon ¡response ¡to ¡hydrogen ¡peroxide ¡is ¡impaired ¡in ¡hypertension. ¡Gao ¡YJ, ¡Zhang ¡Y, ¡Hirota ¡S, ¡Janssen ¡LJ, ¡Lee ¡RM. ¡Br ¡J ¡Pharmacol. ¡2004 ¡May; 142(1):143-­‑9. ¡ ¡ 18] ¡Mechanisms ¡of ¡hydrogen-­‑peroxide-­‑induced ¡biphasic ¡response ¡in ¡rat ¡mesenteric ¡artery. ¡Gao ¡YJ, ¡Hirota ¡S, ¡Zhang ¡DW, ¡Janssen ¡LJ, ¡Lee ¡RM. ¡Br ¡J ¡Pharmacol. ¡ 2003 ¡Mar;138(6):1085-­‑92. ¡

¡

Simon ¡Hirota ¡ Assistant ¡Professor, ¡Dept. ¡of ¡Physiology ¡& ¡Pharmacology, ¡ University ¡of ¡Calgary ¡ GastrointesVnal ¡inflammaVon ¡-­‑ ¡inflammatory ¡bowel ¡diseases ¡

• ­‑ ¡intesVnal ¡epithelium ¡-­‑ ¡Crohn's ¡disease ¡-­‑ ¡

ulceraVve ¡coliVs ¡ Google ¡Scholar ¡

Take ¡on ¡Challenges! ¡

• Get ¡involved; ¡

– Teaching! ¡ – Seminars! ¡ – Mentoring! ¡ – CollaboraVng! ¡ – Extra-­‑curricular ¡acVviVes! ¡ – Be ¡a ¡team ¡player! ¡ – Organize ¡MeeVngs! ¡ – Review ¡papers ¡and ¡grants! ¡

“Now ¡that ¡is ¡the ¡kind ¡of ¡person ¡I ¡want ¡ as ¡a ¡colleague” ¡

What ¡Field ¡Should ¡I ¡Go ¡In ¡To? ¡

• Enhance ¡the ¡interplay! ¡
• ProtecVon! ¡
• AFP ¡vs ¡no ¡AFP? ¡
• Family ¡expectaVons? ¡
• Know ¡your ¡strengths ¡and ¡

weakness! ¡ ¡

• What ¡excites ¡you ¡most? ¡
• Find ¡your ¡niche! ¡
• What ¡makes ¡you ¡happy? ¡

¡

15-­‑03-­‑31 ¡ 7 ¡

Disease ¡severity ¡spectrum ¡

– ‘carrier’ ¡state ¡→ ¡diarrhea ¡→ ¡ pseudomembranous ¡coliVs ¡→ ¡toxic ¡ megacolon ¡ – High ¡recurrence ¡rates ¡ – Marked ¡disease ¡variability ¡

Treatment ¡

• CessaVon ¡of ¡current ¡anVbioVc ¡

regimen ¡

• AnVbioVcs ¡to ¡target ¡C. ¡difficile ¡
• ?ProbioVcs ¡
• ?Toxin ¡binding ¡agents ¡
• Surgery ¡

– ~50% ¡mortality ¡

What’s ¡Happening ¡with ¡C. ¡difficile ¡ Be ¡Good ¡To ¡Your ¡Self! ¡ What ¡is ¡Your ¡Goal ¡

• Where ¡do ¡you ¡want ¡to ¡go? ¡

– Academic ¡seqng ¡ – Industry? ¡ – Other? ¡

• What ¡is ¡your ¡Vmeline? ¡
• Are ¡you ¡compeVVve ¡for ¡funding? ¡

What ¡is ¡Your ¡Niche? ¡

• Interest/IdenVty ¡
• How ¡do ¡people ¡know ¡you? ¡

– “oh ¡she ¡is ¡the ¡microbiome ¡lung ¡woman” ¡

• Viability ¡

– Funding ¡ – Future ¡

• Support ¡

– To ¡start ¡ – To ¡grow ¡

15-­‑03-­‑31 ¡ 8 ¡

Choosing ¡a ¡Mentor/Lab ¡

• Mentoring ¡Style? ¡
• Successes ¡of ¡other ¡students? ¡
• Collaborator? ¡
• Size ¡of ¡Lab? ¡
• Focus? ¡
• Launch ¡plans ¡up ¡front? ¡

Nature ¡or ¡Nothing? ¡ My ¡way ¡or ¡the ¡highway! ¡ SVck ¡to ¡one ¡project ¡or ¡else! ¡

15-­‑03-­‑31 ¡ 9 ¡

Money? ¡

• Are ¡you ¡compe55ve ¡for ¡funding? ¡

– How ¡much ¡do ¡post-­‑docs ¡make? ¡

• Cost ¡of ¡moving? ¡
• Cost ¡of ¡living ¡(rent, ¡child ¡care, ¡healthcare ¡etc)? ¡
• Any ¡other ¡resources? ¡

– Top ¡ups? ¡ – Chance ¡for ¡other ¡awards? ¡ – Can ¡you ¡work ¡part ¡5me? ¡ – Can ¡you ¡get ¡credit? ¡

• Family; ¡who, ¡what, ¡when, ¡where ¡and ¡how ¡ ¡

– (most ¡know ¡the ¡why) ¡

The ¡How ¡Do ¡You ¡Have ¡Kids ¡Ques5on! ¡

Going ¡to ¡Industry ¡

• Bart ¡de ¡Vos, ¡who ¡oversees ¡about ¡70 ¡research ¡postdocs ¡at ¡

Genentech ¡"If ¡they ¡don't ¡stay ¡in ¡contact ¡with ¡their ¡peers ¡ and ¡advisers, ¡they ¡get ¡out ¡of ¡touch ¡with ¡the ¡academic ¡ culture,“ ¡

• “People ¡who ¡go ¡back ¡to ¡academia ¡want ¡more ¡ownership ¡
• f ¡their ¡research ¡and ¡accept ¡lower ¡funding ¡and ¡support ¡as ¡

a ¡trade-­‑off” ¡

• “Industry ¡postdocs ¡are ¡less ¡experienced ¡in ¡wriSng ¡grants ¡

and ¡fellowship ¡applicaSons ¡than ¡their ¡peers ¡in ¡academia” ¡

• “….candidates ¡from ¡industry ¡bring ¡valuable ¡skills ¡and ¡
• experience. ¡They ¡have ¡learned ¡how ¡to ¡conduct ¡pracScal ¡

research ¡as ¡part ¡of ¡a ¡team ¡and ¡how ¡to ¡manage ¡projects.” ¡

• “…postdocs ¡receive ¡roughly ¡the ¡same ¡amount ¡of ¡training ¡

in ¡either ¡sector.” ¡ ¡

Nature ¡429, ¡324-­‑325 ¡(May ¡2004) ¡| ¡10.1038/nj6989-­‑324a ¡

Life ¡Aner ¡A ¡PhD ¡

• “…it should be your aim as a postdoc to publish a first‐author
• paper. In psychology ‘10’ is the magic number of publications

universities look for when hiring, in engineering 3 or 4. It is not necessary for all the papers to be first author.”

• How important is it to have a first author publication when

seeking a postdoc?

– “Critical… It’s a way of demonstrating that your thesis work made an

• riginal and new contribution to the field.”
• How many letters of recommendations do you need when

applying for postdocs?

– You need 3. – Good to have 1 from major advisor, 1 from committee member. It would be outstanding if your third letter was from someone in your field who knows your graduate work (this looks good). – Much better if the letter is from a faculty member

From; ¡Life ¡aner ¡the ¡PhD: ¡Finding ¡the ¡Right ¡Postdoctoral ¡PosiVon ¡ www.bu.edu/agep/files/2010/04/AGEP-­‑Postdoc-­‑Event-­‑Notes4.pdf ¡

15-­‑03-­‑31 ¡ 10 ¡

Life ¡Aner ¡A ¡PhD ¡

From; ¡Life ¡aner ¡the ¡PhD: ¡Finding ¡the ¡Right ¡Postdoctoral ¡PosiVon ¡ www.bu.edu/agep/files/2010/04/AGEP-­‑Postdoc-­‑Event-­‑Notes4.pdf ¡

Is ¡a ¡Post-­‑Doc ¡a ¡Guaranteed ¡Faculty ¡ PosiVon? ¡

• “For ¡years ¡postdocs ¡have ¡heard ¡that ¡a ¡postdoc ¡is ¡a ¡

training ¡ground ¡for ¡a ¡tenure-­‑track ¡posi<on” ¡

• “ ¡this ¡causes ¡them ¡not ¡to ¡think ¡about ¡their ¡own ¡

strategic ¡career ¡plan, ¡because ¡they ¡think ¡the ¡postdoc ¡ will ¡naturally ¡flow ¡into ¡a ¡tenure-­‑track ¡posi<on.“ ¡ ¡

• “only ¡20 ¡percent ¡of ¡postdocs ¡advance ¡to ¡tenure-­‑track ¡

employment, ¡many ¡find ¡themselves ¡realizing ¡too ¡late, ¡

• r ¡wai<ng ¡too ¡long, ¡to ¡make ¡a ¡career ¡plan ¡with ¡

tangible ¡con<ngency ¡op<ons” ¡ ¡ ¡Cathee ¡Phillips, ¡execu<ve ¡director ¡of ¡the ¡Na<onal ¡Postdoctoral ¡Associa<on ¡(NPA). ¡ ¡

¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡www. ¡sciencecareers.sciencemag.org ¡

Have ¡a ¡dream ¡but ¡also ¡some ¡back ¡up ¡plans! ¡

Resources ¡

• CIHR ¡
• CAG ¡
• Provincial ¡
• NIH ¡
• Industry ¡
• Other ¡

– www. ¡sciencecareers.sciencemag.org ¡

– www.findapostdoc.com/firstmain.asp ¡

– www.postdocjobs.com ¡

– Life ¡aner ¡the ¡PhD: ¡Finding ¡the ¡Right ¡Postdoctoral ¡PosiVon ¡ www.bu.edu/agep/files/2010/04/AGEP-­‑Postdoc-­‑Event-­‑ Notes4.pdf ¡

My ¡4 ¡Points ¡for ¡Success ¡

• Work ¡hard! ¡
• Be ¡morally ¡and ¡ethically ¡sound! ¡
• Be ¡nice ¡to ¡people! ¡ ¡
• Strive ¡to ¡be ¡happy! ¡

¡

Good ¡Luck ¡on ¡Your ¡ Journey! ¡