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Pe$a ¡Radeva ¡ ¡ ¡University ¡of ¡Barcelona ¡& ¡
Computer ¡Vision ¡Center ¡ ¡
purposes Pe$a Radeva University of Barcelona & - - PowerPoint PPT Presentation
Visual Lifelogging: using non-medical images for medical purposes Pe$a Radeva University of Barcelona & Computer Vision Center Medical
Computer ¡Vision ¡Center ¡ ¡
the ¡interior ¡of ¡a ¡body ¡for ¡clinical ¡analysis ¡and ¡medical ¡interven6on. ¡ ¡
– Medical ¡imaging ¡seeks ¡to ¡reveal ¡internal ¡structures ¡hidden ¡by ¡the ¡skin ¡and ¡bones, ¡as ¡ well ¡as ¡ ¡ – To ¡diagnose ¡and ¡treat ¡disease. ¡ ¡
make ¡it ¡possible ¡to ¡iden6fy ¡abnormali$es. ¡ ¡
– Although ¡imaging ¡of ¡removed ¡organs ¡and ¡6ssues ¡can ¡be ¡performed ¡for ¡medical ¡reasons, ¡ such ¡procedures ¡are ¡usually ¡considered ¡part ¡of ¡pathology ¡instead ¡of ¡medical ¡imaging. ¡
– ¡X-‑ray ¡radiography, ¡MRI,CT, ¡UC, ¡endoscopy, ¡elastography, ¡tac6le ¡imaging, ¡ thermography, ¡PET, ¡SPECT, ¡etc. ¡
– ¡“Invisible ¡light" ¡medical ¡imaging ¡is ¡generally ¡equated ¡to ¡radiology… ¡ ¡ – "Visible ¡light" ¡medical ¡imaging ¡involves ¡digital ¡video ¡or ¡s6ll ¡pictures ¡that ¡can ¡be ¡seen ¡ without ¡special ¡equipment ¡(dermatology). ¡
Scenario: ¡
angiographies! ¡
ntraopera6ve ¡imaging ¡tool ¡to ¡inspect ¡plaque ¡and ¡ guide ¡vessel ¡interven6on ¡ ¡
Normal ¡ Stent ¡ Ca++ ¡ Ca++ ¡> ¡180º ¡ Automa6c ¡Lumen ¡ Manual ¡Lumen ¡ Automa6c ¡MAb ¡ Manual ¡MAb ¡
Hypothesis: ¡Computer ¡Vision ¡and ¡Machine ¡Learning ¡allow ¡to ¡
develop ¡an ¡automa6c ¡system ¡for ¡categoirza6on ¡of ¡intes6ne ¡mo6lity ¡to ¡ diagnose ¡diges6ve ¡diseases ¡
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Scenario: ¡One ¡third ¡of ¡people ¡during ¡ their ¡life ¡– ¡diges6ve ¡problems! ¡
¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ Scenario: ¡Agita6on ¡occurs ¡very ¡frequently ¡ in ¡the ¡Intensive ¡Care ¡Unit ¡(ICU), ¡affec6ng ¡ 71% ¡of ¡sedated ¡adult ¡pa6ents ¡during ¡58% ¡
Hypothesis: ¡Agita6on ¡detec6on ¡can ¡be ¡
¡ ¡ ¡ Applica$on ¡to ¡neurorehabilita$on ¡
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Goal: ¡to ¡develop ¡tools ¡for ¡memory ¡reforcing ¡of ¡MCI ¡and ¡Alzheimer ¡people. ¡
To ¡develop, ¡for ¡subjects ¡with ¡MCI, ¡a ¡program-‑based ¡life-‑logging ¡captured ¡by ¡a ¡Wearable ¡Camera ¡ recording ¡specific ¡autobiographical ¡episodes ¡for ¡s$mula$ng ¡posteriorly ¡episodic ¡memory ¡func$on ¡ known ¡to ¡be ¡deficient ¡in ¡MCI. ¡ ¡
Defini$on: ¡Visual ¡life-‑logging ¡consists ¡of ¡acquiring ¡images ¡related ¡to ¡an ¡individual ¡ through ¡a ¡wearable ¡camera. ¡ Benefits: ¡
par6cipated ¡in. ¡ ¡
– This ¡memory ¡would ¡be ¡searchable, ¡retrievable, ¡and ¡shareable. ¡
– This ¡data ¡could ¡serve ¡as ¡a ¡warning ¡system ¡and ¡also ¡as ¡a ¡personal ¡base ¡upon ¡which ¡to ¡diagnosis ¡illness ¡and ¡to ¡prescribe ¡medicines. ¡
– A ¡complete ¡archive ¡of ¡your ¡work ¡and ¡play, ¡and ¡your ¡work ¡habits. ¡Deep ¡compara6ve ¡analysis ¡of ¡your ¡ac6vi6es ¡could ¡assist ¡your ¡ produc6vity, ¡crea6vity, ¡and ¡consump6vity. ¡
amplify ¡social ¡interac$ons, ¡and ¡in ¡the ¡biological ¡realm, ¡shared ¡medical ¡logs ¡could ¡rapidly ¡advance ¡ medicine ¡discoveries. ¡
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Evolu6on ¡of ¡life-‑logging ¡apparatus, ¡including ¡wearable ¡computer, ¡camera, ¡and ¡viewfinder ¡with ¡wireless ¡Internet ¡connec6on. ¡Early ¡apparatus ¡used ¡ separate ¡transmijng ¡and ¡receiving ¡antennas. ¡Later ¡apparatus ¡evolved ¡toward ¡the ¡appearance ¡of ¡ordinary ¡eyeglasses ¡in ¡the ¡late ¡1980s ¡and ¡early ¡1990s. ¡
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“Quan6fied ¡Self ¡& ¡life-‑logging ¡MeetsInternet ¡of ¡Things ¡(IOT)”, ¡ ¡Mazzlan ¡Abbas. ¡
and ¡tens ¡of ¡millions ¡of ¡photographs. ¡ ¡
– This ¡should ¡sa6sfy ¡most ¡life-‑loggers’ ¡ ¡recording ¡needs ¡for ¡an ¡en$re ¡life. ¡
– From ¡2000 ¡it ¡became ¡trivial ¡and ¡cheap ¡to ¡sock ¡away ¡tremendous ¡piles ¡of ¡data. ¡ ¡
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“Total: ¡How ¡the ¡E-‑memory ¡revolu6on ¡will ¡change ¡everything”, ¡Gordon ¡Bell ¡and ¡Jim ¡Gemmel, ¡2009, ¡Duson, ¡Penguin ¡Group. ¡ ¡
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The ¡Moore’s ¡Law ¡(1965): ¡ ¡“Transistor ¡density ¡that ¡can ¡be ¡etched ¡onto ¡the ¡silicon ¡wafer ¡of ¡a ¡ microchip ¡doubles ¡every ¡two ¡years”. ¡ ¡
“Total: ¡How ¡the ¡E-‑memory ¡revolu6on ¡will ¡change ¡everything”, ¡Gordon ¡Bell ¡and ¡Jim ¡Gemmel, ¡2009, ¡Duson, ¡Penguin ¡Group. ¡ ¡
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The ¡Moore’s ¡Law ¡(1965): ¡ ¡“Transistor ¡density ¡that ¡can ¡be ¡etched ¡onto ¡the ¡silicon ¡wafer ¡of ¡a ¡ microchip ¡doubles ¡every ¡two ¡years”. ¡ ¡
The ¡hard ¡part ¡is ¡no ¡longer ¡deciding ¡what ¡to ¡hold ¡on ¡to, ¡but ¡how ¡ to ¡efficiently ¡organize ¡it, ¡sort ¡it, ¡access ¡it, ¡and ¡find ¡pacerns ¡and ¡ meaning ¡in ¡it. ¡ ¡ ¡ ¡
This ¡is ¡a ¡primary ¡challenge ¡for ¡the ¡engineers ¡that ¡will ¡fully ¡unleash ¡ the ¡power ¡of ¡Total ¡Recall. ¡ ¡
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Don’t ¡you ¡love ¡to ¡know… ¡ ¡
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30 ¡days ¡report ¡of ¡Max ¡Knoblauch ¡
Life-‑logging ¡everything ¡you ¡see, ¡do, ¡feel, ¡ speak, ¡experience ¡and ¡hear ¡is ¡almost ¡here. ¡ ¡
The ¡really ¡big ¡issue ¡here ¡is ¡that ¡you ¡might, ¡ individually, ¡not ¡worry ¡about ¡publishing ¡details ¡of ¡ your ¡personal ¡life. ¡ ¡
and ¡business ¡contacts ¡details ¡at ¡the ¡same ¡ $me. ¡ ¡ Wearable ¡camera ¡can ¡provide ¡many ¡benefits, ¡such ¡as ¡ assis6ve ¡technologies ¡to ¡help ¡people: ¡ ¡
– not ¡discuss ¡the ¡content ¡with ¡anyone ¡outside ¡of ¡the ¡team, ¡ – not ¡iden6fy ¡anyone ¡they ¡recognize ¡in ¡the ¡images, ¡ ¡ – be ¡aware ¡of ¡how ¡sensi6ve ¡the ¡data ¡are. ¡
specialist ¡viewing ¡soxware ¡to ¡make ¡the ¡images ¡accessible ¡only ¡to ¡the ¡research ¡team ¡(lost ¡ devices). ¡
– Devices ¡should ¡be ¡configured ¡so ¡that ¡data ¡can ¡only ¡be ¡retrieved ¡by ¡the ¡research ¡team. ¡It ¡should ¡ be ¡impossible ¡for ¡par6cipants ¡or ¡third ¡par6es ¡who ¡find ¡devices ¡to ¡access ¡the ¡images. ¡
according ¡to ¡na6onal ¡regula6ons. ¡ ¡
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1. understanding ¡the ¡future ¡value ¡of ¡revealing ¡private ¡informa6on ¡ today, ¡ 2. understanding ¡the ¡risks ¡from ¡technology ¡they ¡have ¡not ¡yet ¡used ¡
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Wearable ¡cameras ¡can ¡be ¡very ¡useful: ¡
¡ An ¡es6mated ¡one ¡million ¡Russian ¡motorists ¡have ¡dashboard ¡video ¡cameras ¡installed ¡in ¡their ¡cars. ¡ ¡ ¡ Police ¡officers ¡carring ¡video ¡camera ¡units ¡and ¡using ¡Velcro ¡to ¡place ¡these ¡cameras ¡in ¡police ¡wagons, ¡ helmet ¡cams, ¡ear ¡cams, ¡chest ¡cams ¡with ¡audio ¡capability, ¡GPS ¡locators, ¡taser ¡cams ¡ ¡
department ¡in ¡USA ¡had ¡an ¡88 ¡% ¡decline ¡in ¡the ¡number ¡of ¡complaints ¡filed ¡against ¡officers, ¡ compared ¡with ¡the ¡12 ¡months ¡before ¡the ¡study”, ¡The ¡New ¡York ¡Times, ¡4th ¡of ¡July, ¡2013. ¡
¡ ¡
¡ ¡ The ¡world’s ¡leading ¡police ¡ body ¡worn ¡video ¡camera ¡ deployed ¡by ¡over ¡4000 ¡ agencies ¡in ¡16 ¡countries. ¡
can ¡discreetly ¡take ¡photos ¡or ¡videos. ¡Will ¡the ¡benefits ¡outweigh ¡the ¡nega6ves? ¡
“Quan6fied ¡Self ¡& ¡life-‑logging ¡Meets ¡Internet ¡of ¡Things ¡(IOT)”, ¡Dr. ¡Mazlan ¡Abbas, ¡MIMOS ¡Berhad ¡
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Defini$on: ¡Visual ¡life-‑logging ¡consists ¡of ¡acquiring ¡images ¡related ¡to ¡an ¡individual ¡ through ¡a ¡wearable ¡camera. ¡ ¡ Benefits: ¡
par6cipated ¡in. ¡ ¡
– This ¡memory ¡would ¡be ¡searchable, ¡retrievable, ¡and ¡shareable. ¡
– This ¡data ¡could ¡serve ¡as ¡a ¡warning ¡system ¡and ¡also ¡as ¡a ¡personal ¡base ¡upon ¡which ¡to ¡diagnosis ¡illness ¡and ¡to ¡prescribe ¡medicines. ¡
– A ¡complete ¡archive ¡of ¡your ¡work ¡and ¡play, ¡and ¡your ¡work ¡habits. ¡Deep ¡compara6ve ¡analysis ¡of ¡your ¡ac6vi6es ¡could ¡assist ¡your ¡ produc6vity, ¡crea6vity, ¡and ¡consump6vity. ¡
amplify ¡social ¡interac$ons, ¡and ¡in ¡the ¡biological ¡realm, ¡shared ¡medical ¡logs ¡could ¡rapidly ¡advance ¡ medicine ¡discoveries. ¡
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– not ¡discuss ¡the ¡content ¡with ¡anyone ¡outside ¡of ¡the ¡team, ¡ – not ¡iden6fy ¡anyone ¡they ¡recognize ¡in ¡the ¡images, ¡ ¡ – be ¡aware ¡of ¡how ¡sensi6ve ¡the ¡data ¡are. ¡
specialist ¡viewing ¡soxware ¡to ¡make ¡the ¡images ¡accessible ¡only ¡to ¡the ¡research ¡team ¡(lost ¡ devices). ¡
– Devices ¡should ¡be ¡configured ¡so ¡that ¡data ¡can ¡only ¡be ¡retrieved ¡by ¡the ¡research ¡team. ¡It ¡should ¡ be ¡impossible ¡for ¡par6cipants ¡or ¡third ¡par6es ¡who ¡find ¡devices ¡to ¡access ¡the ¡images. ¡
according ¡to ¡na6onal ¡regula6ons. ¡
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and ¡tens ¡of ¡millions ¡of ¡photographs. ¡ ¡
– This ¡should ¡sa6sfy ¡most ¡life-‑loggers’ ¡ ¡recording ¡needs ¡for ¡an ¡en$re ¡life. ¡
– From ¡2000 ¡it ¡became ¡trivial ¡and ¡cheap ¡to ¡sock ¡away ¡tremendous ¡piles ¡of ¡data. ¡ ¡
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“Total: ¡How ¡the ¡E-‑memory ¡revolu6on ¡will ¡change ¡everything”, ¡Gordon ¡Bell ¡and ¡Jim ¡Gemmel, ¡2009, ¡Duson, ¡Penguin ¡Group. ¡ ¡
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The ¡Moore’s ¡Law ¡(1965): ¡ ¡“Transistor ¡density ¡that ¡can ¡be ¡etched ¡onto ¡the ¡silicon ¡wafer ¡of ¡a ¡ microchip ¡doubles ¡every ¡two ¡years”. ¡ ¡
“Total: ¡How ¡the ¡E-‑memory ¡revolu6on ¡will ¡change ¡everything”, ¡Gordon ¡Bell ¡and ¡Jim ¡Gemmel, ¡2009, ¡Duson, ¡Penguin ¡Group. ¡ ¡
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The ¡Moore’s ¡Law ¡(1965): ¡ ¡“Transistor ¡density ¡that ¡can ¡be ¡etched ¡onto ¡the ¡silicon ¡wafer ¡of ¡a ¡ microchip ¡doubles ¡every ¡two ¡years”. ¡ ¡
The ¡hard ¡part ¡is ¡no ¡longer ¡deciding ¡what ¡to ¡hold ¡on ¡to, ¡but ¡how ¡ to ¡efficiently ¡organize ¡it, ¡sort ¡it, ¡access ¡it, ¡and ¡find ¡pacerns ¡and ¡ meaning ¡in ¡it. ¡ ¡ ¡ ¡
This ¡is ¡a ¡primary ¡challenge ¡for ¡the ¡engineers ¡that ¡will ¡fully ¡unleash ¡ the ¡power ¡of ¡Total ¡Recall. ¡ ¡
¡ Events ¡to ¡be ¡extracted ¡from ¡life-‑logging ¡images ¡
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Complete ¡dataset ¡of ¡a ¡day ¡captured ¡with ¡SenseCam ¡(more ¡than ¡4,100 ¡images ¡
IMEC, ¡University ¡of ¡Eindhoven, ¡March, ¡ 2015 ¡ 21 ¡
Choice ¡of ¡devise ¡depends ¡on: ¡ ¡ 1) ¡where ¡ ¡they ¡are ¡set: ¡a ¡hung ¡up ¡camera ¡has ¡ the ¡advantage ¡that ¡is ¡considered ¡more ¡ unobtrusive ¡for ¡the ¡user, ¡or ¡ ¡ 2) ¡their ¡temporal ¡resolu6on: ¡a ¡camera ¡with ¡a ¡ low ¡fps ¡will ¡capture ¡less ¡mo6on ¡informa6on, ¡ but ¡we ¡will ¡need ¡to ¡process ¡less ¡data. ¡ We ¡chose ¡a ¡SenseCam ¡or ¡Narra6ve ¡-‑ ¡cameras ¡ hung ¡on ¡the ¡neck ¡or ¡pinned ¡on ¡the ¡dress ¡that ¡ capture ¡2-‑4 ¡fps. ¡
University ¡of ¡Groningen, ¡November, ¡2014 ¡ 22 ¡
¡
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Video ¡segmenta6on ¡and ¡key-‑frame ¡extrac6on ¡ ¡
ì
Mo6on-‑based ¡segmenta6on ¡towards ¡ac6vi6es ¡ recogni6on ¡
ì
Human ¡tracking, ¡towards ¡social ¡interac6on ¡ ¡
ì
Object ¡recogni6on ¡ ¡
ì
Daily ¡pasern ¡extrac6on ¡
ì
Lifestyle ¡characteriza6on, ¡etc, ¡etc. ¡
What? ¡Where? ¡When? ¡Who? ¡
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One ¡of ¡the ¡challenges ¡of ¡life-‑logging ¡is ¡how ¡to ¡organize ¡the ¡big ¡amount ¡of ¡image ¡data ¡acquired ¡in ¡seman6cally ¡ meaningful ¡segments ¡in ¡order ¡to ¡be ¡able ¡to ¡store ¡them ¡and ¡review ¡later, ¡being ¡able ¡to ¡focus ¡just ¡on ¡the ¡most ¡ important ¡aspects. ¡
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Data ¡set: ¡ thousands ¡of ¡ images ¡ Features ¡ Extrac6on ¡ Clustering ¡
Daily ¡Video ¡ Summariza6on ¡ RGB+HOG ¡ CNN ¡ Ward ¡ k-‑Means ¡ Spectral ¡Clustering ¡
Event ¡extrac$on ¡ Event ¡characteriza$on ¡
Towards: ¡
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Gradient ¡histograms ¡measure ¡the ¡orienta6ons ¡and ¡strengths ¡of ¡image ¡ gradients ¡within ¡an ¡image ¡region ¡
27 ¡
Color ¡ ¡
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Master ¡class: ¡Human ¡and ¡Object ¡ Recogni6on ¡ 29 ¡
30 ¡
31 ¡
ImageNet: ¡15 ¡millions ¡of ¡images!!! ¡Used ¡to ¡train ¡the ¡CNN. ¡ ¡
32 ¡
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35 ¡
Color ¡ ¡ Structure ¡ 6me ¡
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Master ¡class: ¡Human ¡and ¡Object ¡Recogni$on ¡
Given ¡the ¡feature ¡vectors ¡per ¡frame, ¡we ¡need ¡to ¡cluster ¡them ¡in ¡order ¡to ¡detect ¡the ¡similar ¡ frames ¡ Different ¡clustering ¡techniques ¡can ¡be ¡found ¡in ¡ the ¡bibliography: ¡
Based ¡on ¡the ¡analysis ¡of ¡the ¡similarity ¡matrix ¡A_ij ¡btw ¡frames ¡I ¡and ¡j. ¡
ì Spectral ¡Clustering ¡
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F-‑measure: ¡FM ¡= ¡2(R*P)/(R ¡+ ¡P), ¡where: ¡ ¡
IMEC, ¡University ¡of ¡Eindhoven, ¡March, ¡ 2015 ¡ 39 ¡
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Person ¡1 ¡ Person ¡1 ¡ Person ¡2 ¡
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and ¡their ¡context ¡rela6on, ¡
lifestyle ¡of ¡individuals, ¡ ¡
them, ¡ ¡
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¡ ¡ ¡ fMRI ¡ MRI ¡
¡
effect ¡of ¡behaviour ¡interven6on. ¡
applica6ons ¡to ¡different ¡diseases ¡(mental, ¡cardiovascular, ¡metabolic). ¡
preven6on ¡(primary ¡and ¡secondary). ¡
¡
(understood ¡as ¡any ¡signal ¡in ¡living ¡beings ¡that ¡can ¡be ¡con6nually ¡measured ¡and ¡ monitored) ¡ ¡is ¡a ¡very ¡rich ¡and ¡novel ¡research ¡field ¡with ¡big ¡poten6al ¡for ¡ challenging ¡and ¡not ¡expoited ¡yet ¡applica6ons. ¡