e.Mosaic We strive to be a transforma/ve 3rd space - - PowerPoint PPT Presentation

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e.Mosaic We strive to be a transforma/ve 3rd space - - PowerPoint PPT Presentation

Sep 05, 2022 40 likes •341 views

e.Mosaic We strive to be a transforma/ve 3rd space Third spaces are necessary for crea/ng the types of problem solvers for a world where

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e.Mosaic

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We ¡strive ¡to ¡be ¡a ¡ transforma/ve ¡ 3rd ¡space ¡

Third ¡spaces ¡are ¡necessary ¡for ¡crea/ng ¡ the ¡types ¡of ¡problem ¡solvers ¡for ¡a ¡ world ¡where ¡technology ¡outpaces ¡ educa/onal ¡curriculums, ¡where ¡the ¡ problems ¡and ¡more ¡importantly ¡the ¡ tools ¡of ¡tomorrow ¡do ¡not ¡yet ¡exist. ¡

4 ¡

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Making and Tinkering

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Can we prototype an exhibit that engages the public in a hands-on synthetic biology experience?

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  • Create an activity in which visitors help

make AND analyze multi-colored bacteria.

  • Allows museum visitors to become part of
  • ur iGEM team!
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  • 1. Build the tools
  • 1. Biology
  • 2. Software
  • 2. Exhibit prototyping
  • 1. Integrate biology, software, hardware
  • 3. Evaluate with museum visitors
  • 1. Community engagement
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  • Goal: random color diversity in bacteria

Brainbow ¡(mouse ¡hippocampus) ¡

hBp://cbs.fas.harvard.edu/science/connectome-­‑project/brainbow ¡

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  • 3 fluorescent

reporters

– RFP – YFP – CFP

  • 3 promoter-rbs

slots

  • 9 promoters-rbs

pairs of varying strengths

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  • Bacterial pixels
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  • Goal: collect data about bacteria color
  • Developed two apps:

– RainbowReader

  • Images and analyzes colonies

– eColor

  • Visualization of color data
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  • Track plates: barcode scanner
  • Image plates: camera + g-photo
  • Analyze colonies: openCFU

– Finds colonies – RGB value of each – Rarity

  • Define colors: xkcd color name database
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Only ¡found ¡1 ¡/mes! ¡ Only ¡found ¡10 ¡/mes! ¡ Only ¡found ¡18 ¡/mes! ¡

OpenCFU ¡

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  • 1. Build the tools
  • 1. Biology
  • 2. Software
  • 2. Exhibit prototyping
  • 1. Integrate biology, software, hardware
  • 3. Evaluate with museum visitors
  • 1. Community engagement
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  • 2. Analyze

colony color

  • 1. Transform bacteria with

tri-color plasmid pool

  • 3. Add contribution

to group data

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Live visualization:

– White shows individual contribution to iGEM project

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  • 1. Build the tools
  • 1. Biology
  • 2. Software
  • 2. Exhibit prototyping
  • 1. Integrate biology, software, hardware
  • 3. Evaluate with museum visitors
  • 1. Community engagement
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  • Interacted with ~ 100 visitors on museum

floor

  • Incorporated visitor feedback into exhibit

design and content

  • 61 individual experiments

– 2674 colonies – 324 unique colors

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Designing for inclusiveness

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The ¡Tech ¡ ¡

MUSUEM ¡VISITORS! ¡ Romie ¡LiBrell ¡ Anja ¡Scholze ¡

SoXware ¡Team ¡

Frank ¡Capodieci ¡ Michael ¡Nagle ¡ Alex ¡Alekseyenko ¡