Anatomy of a transposon Figure 14.3 Examples of some - - PowerPoint PPT Presentation

Anatomy ¡of ¡a ¡transposon ¡ ¡

Figure ¡14.3 ¡

Examples ¡of ¡some ¡bacterial ¡transposons ¡

Figure ¡14.10 ¡

Figure 10.27

IS2 Tn5

IS50L IS50R tnp tnp kan str bleo

Composite ¡transposons ¡have ¡ ¡ two ¡inser8on ¡elements ¡

Figure ¡14.11 ¡

Adapted ¡from ¡L. ¡Snyder ¡and ¡W. ¡Champness. ¡Molecular ¡Gene,cs ¡of ¡Bacteria, ¡Second ¡ edi,on. ¡ASM ¡Press, ¡2003. ¡

The ¡transposase ¡binds ¡the ¡inverted ¡repeats ¡

Figure ¡14.4 ¡

Repair ¡of ¡gaps ¡flanking ¡the ¡new ¡inser8on ¡result ¡in ¡ target ¡site ¡duplica8on ¡

Figure ¡14.5 ¡

Figure 10.28

Target DNA sequence Transposable element

Duplicated target sequence

Insertion

Figure 10.29

Conservative transposition Replicative transposition

Target sequence Donor DNA with break Transposon in new location Donor DNA undamaged Transposon excised from donor Transposon replicates

n s p

• s

n s p

• s

n s p

• s

n s p

• s

Ori st DNA Ori st DNA Ori st D N A Tar g e t e c u l e Tar get mol e c u

Replica8ve ¡transposons ¡leave ¡one ¡copy ¡of ¡the ¡ element ¡at ¡the ¡donor ¡site ¡

Figure ¡14.12 ¡

Cut-­‑and-­‑paste ¡transposi8on ¡results ¡in ¡excision ¡ and ¡integra8on ¡at ¡a ¡new ¡site ¡

Figure ¡14.8 ¡

Adapted ¡from ¡N. ¡C. ¡Craig, ¡et ¡al., ¡eds. ¡Mobile ¡DNA ¡II. ¡ASM ¡Press, ¡2002. ¡

Regula8ng ¡transposi8on ¡with ¡DNA ¡ replica8on ¡can ¡increase ¡copy ¡number ¡of ¡cut-­‑ and-­‑paste ¡transposons ¡

Figure 14.9

Figure 10.30

Disrupted gene 2 Gene A Gene 1 Gene 2 Gene 3 Gene 1 Gene A Gene 3 Transposon Chromosome Chromosome Transposition

Transposition often results in a mutation since the newly moved Tn inactivates the gene where it has inserted.

Eukaryo8c ¡transposons ¡are ¡ ¡ similar ¡to ¡those ¡in ¡bacteria ¡

Figure ¡14.13 ¡

Adapted ¡from ¡F. ¡Bushman. ¡Lateral ¡DNA ¡Transfer: ¡Mechanisms ¡and ¡

• Consequences. ¡Cold ¡Spring ¡Harbor ¡Laboratory ¡Press, ¡2002. ¡