NahR SAM AHL Integrase TetR Lux Pr Anderson - - PowerPoint PPT Presentation

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Dec 10, 2022 166 likes •524 views

NahR SAM AHL Integrase TetR Lux Pr Anderson LuxI LuxI GFP RFP LuxR Gene8c switch Characterizing Genetic

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¡ ¡ Integrase ¡ LuxR ¡ RFP ¡ ¡GFP ¡ ¡ ¡ ¡ ¡LuxI ¡ NahR ¡ Lux ¡Pr ¡ ¡ TetR ¡ SAM ¡ AHL ¡ Gene8c ¡switch ¡ ¡ ¡ ¡ ¡LuxI ¡ Anderson ¡ ¡

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pBad ¡

Characterizing Genetic Switch

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Characterizing Genetic Switch

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Characterizing Genetic Switch

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Preliminary Signal Amplification Work

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  • In ground near water source
  • Easy for commercial or

personal use

The Biostake

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  • Containment:
  • Semi-permeable membrane
  • Physical barrier to keep out debris
  • Polyvinyl alcohol hydrogel matrix

(PVA)

  • Immobilizes bacterium
  • Allows diffusion of growth media
  • Diffusion of small molecule analytes
  • Slow influx of surrounding liquid
  • Pump/capillary action
  • Visual color change

The Biostake

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Interlab Measurement Study

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OUTREACH: CPI CONTAMINATION DISPUTE

  • Met with both sides to

pitch our device to gather case-supporting evidence

  • Built cooperative

implementation plan for sensor placement around Jefferson County, Colorado

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COLLABORATION

Fr Fracking Video eo Pr Proj

  • jec

ect Meet eetup Even ent Survey eys Pr Proj

  • jec

ect Mot

  • tivation
  • n
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THANK YOU

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Naphthalene Concentrations and Health Risks

  • Natural ¡Concentra8on: ¡
  • <0.01 ¡ppb ¡in ¡rural ¡regions ¡(where ¡drill ¡sites ¡are ¡located) ¡
  • 0.16 ¡ppm ¡ppb ¡in ¡urban ¡areas ¡
  • World ¡Health ¡Organiza8on ¡(WHO): ¡
  • 0.188 ¡ppm ¡maximum ¡concentra8on ¡
  • Environmental ¡Protec8on ¡Agency ¡
  • ~0.001 ¡ ¡
  • Lethal ¡dose: ¡
  • 650 ¡ppm ¡
  • Causes ¡hemoly8c ¡anemia ¡and ¡nerve ¡damage ¡with ¡prolonged ¡exposure ¡
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NahR Transcriptional Regulator

  • From ¡Peking ¡2013 ¡iGEM ¡team ¡
  • Sensi8vity ¡
  • Can ¡detect ¡0.1-­‑3 ¡µg/L ¡of ¡naphthalene ¡deriva8ves ¡(versus ¡EPA’s ¡0.001 ¡µg/L ¡

regula8on) ¡

  • Supplied ¡in ¡iGEM ¡Distribu8on ¡Kit ¡
  • Comprised ¡of ¡4 ¡separate ¡genes ¡for ¡degrada8on ¡of ¡naphthalene ¡

deriva8ves ¡into ¡salicylate ¡to ¡act ¡upon ¡an ¡inducible ¡promot34 ¡