Mayfly Reproducible Research in Minutes Reproducible Research - PowerPoint PPT Presentation

Mayfly Reproducible ¡Research ¡in ¡Minutes ¡

• Reproducible ¡Research ¡is ¡ the ¡new ¡paradigm ¡ Step ¡1: ¡Configure ¡Environment ¡ • And ¡more ¡graphics ¡should ¡ be ¡interac@ve ¡ Mayfly ¡ • So, ¡why ¡don’t ¡people ¡do ¡it? ¡ • IPython ¡ • R ¡ • Dropbox ¡ • Never ¡learned ¡how ¡ • Dropbox ¡Publisher ¡ • It’s ¡a ¡hassle ¡ ¡ • Configures ¡Dropbox ¡ • No ¡consistent ¡plaGorm ¡ • So: ¡ • Create ¡plaGorm ¡for ¡ reproducible ¡research ¡ • Hosted ¡by ¡OSDC ¡ ¡

Step ¡2: ¡Research! ¡ Data ¡ Mayfly

Why ¡is ¡this ¡a ¡good ¡idea? • Document ¡your ¡research ¡ • Share ¡code, ¡charts, ¡and ¡images ¡ • Host ¡interac@ve ¡visuals! ¡ • Code ¡is ¡already ¡wriPen ¡

Usage ¡case So, ¡ • Mary ¡wants ¡to ¡inves@gate ¡ • Runs ¡setup ¡program ¡ iris ¡flowers ¡ • Points ¡to ¡Python ¡script ¡ • Needs ¡computa@onal ¡ • … ¡ power ¡ • And ¡is ¡given ¡a ¡dropbox ¡link ¡ • Wants ¡visualiza@ons ¡ to ¡her ¡report ¡ • Thinks ¡that ¡reproducible ¡ • Shares ¡with ¡coworkers, ¡gets ¡ research ¡is ¡good ¡ feedback, ¡spots ¡a ¡coding ¡ mistake ¡by ¡her ¡RA… ¡ Mayfly ¡ • IPython ¡ • R ¡ • Dropbox ¡ • Dropbox ¡Publisher ¡ • Configures ¡Dropbox ¡