Mayfly Reproducible Research in Minutes Reproducible Research - - PowerPoint PPT Presentation

mayfly
SMART_READER_LITE
LIVE PREVIEW

Mayfly Reproducible Research in Minutes Reproducible Research - - PowerPoint PPT Presentation

Mayfly Reproducible Research in Minutes Reproducible Research is the new paradigm Step 1: Configure Environment And more graphics should be interac@ve


slide-1
SLIDE 1

Mayfly

Reproducible ¡Research ¡in ¡Minutes ¡

slide-2
SLIDE 2

Mayfly ¡

  • IPython ¡
  • R ¡
  • Dropbox ¡
  • Dropbox ¡Publisher ¡
  • Configures ¡Dropbox ¡
  • Reproducible ¡Research ¡is ¡

the ¡new ¡paradigm ¡

  • And ¡more ¡graphics ¡should ¡

be ¡interac@ve ¡

  • So, ¡why ¡don’t ¡people ¡do ¡it? ¡
  • Never ¡learned ¡how ¡
  • It’s ¡a ¡hassle ¡ ¡
  • No ¡consistent ¡plaGorm ¡
  • So: ¡
  • Create ¡plaGorm ¡for ¡

reproducible ¡research ¡

  • Hosted ¡by ¡OSDC ¡

¡

Step ¡1: ¡Configure ¡Environment ¡

slide-3
SLIDE 3

Data ¡

Mayfly

Step ¡2: ¡Research! ¡

slide-4
SLIDE 4

Why ¡is ¡this ¡a ¡good ¡idea?

  • Document ¡your ¡research ¡
  • Share ¡code, ¡charts, ¡and ¡images ¡
  • Host ¡interac@ve ¡visuals! ¡
  • Code ¡is ¡already ¡wriPen ¡
slide-5
SLIDE 5

Usage ¡case

  • Mary ¡wants ¡to ¡inves@gate ¡

iris ¡flowers ¡

  • Needs ¡computa@onal ¡

power ¡

  • Wants ¡visualiza@ons ¡
  • Thinks ¡that ¡reproducible ¡

research ¡is ¡good ¡

  • Runs ¡setup ¡program ¡
  • Points ¡to ¡Python ¡script ¡
  • … ¡
  • And ¡is ¡given ¡a ¡dropbox ¡link ¡

to ¡her ¡report ¡

  • Shares ¡with ¡coworkers, ¡gets ¡

feedback, ¡spots ¡a ¡coding ¡ mistake ¡by ¡her ¡RA… ¡

So, ¡

Mayfly ¡

  • IPython ¡
  • R ¡
  • Dropbox ¡
  • Dropbox ¡Publisher ¡
  • Configures ¡Dropbox ¡