Mercury as a Global Contaminant Bioaccumula)on into humans S - - PowerPoint PPT Presentation
Mercury as a Global Contaminant Bioaccumula)on into humans S - - PowerPoint PPT Presentation
Mercury as a Global Contaminant Bioaccumula)on into humans S YSTEM M ODELING D EVICE B IOPRECIPITATION O UTREACH O VERVIEW Current Methods to Remove Mercury
Mercury as a Global Contaminant
Bioaccumula)on ¡ ¡into ¡humans ¡
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH OVERVIEW ¡
Current Methods to Remove Mercury
Hg ¡ Hg ¡ Hg ¡
C ¡ C ¡ C ¡
Hg ¡ Hg ¡ Hg ¡ Hg ¡ Hg ¡ Hg ¡ Hg ¡ Hg ¡ Hg ¡ Hg ¡ Hg ¡
Method ¡ Sensi,ve ¡to ¡Other ¡ Contaminants ¡ Remediates ¡all ¡Major ¡ Species ¡of ¡Hg ¡ Results ¡in ¡ Potable ¡Water ¡ Poten,al ¡Toxic ¡ Byproducts ¡ ¡ Cost ¡ Precipita)on ¡
✔ ¡ ✖ ¡ ✖ ¡ ✔ ¡ $$ ¡
Adsorp)on ¡
✔ ¡ ✖ ¡ ✖ ¡ ✖ ¡ $ ¡
Membrane ¡Filtra)on ¡
✔✔ ¡ ✔ ¡ ✔ ¡ ✔ ¡ $$$ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡Precipita)on ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡Adsorp)on ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡Membrane ¡Filtra)on ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH OVERVIEW ¡
The Biological System
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH PROBLEM ¡ SYSTEM
Hg2+ ¡
Function of the mer Operon
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH PROBLEM ¡ SYSTEM
Hg2+ ¡ Hg2+ ¡
Function of the mer Operon
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH PROBLEM ¡ SYSTEM
Hg2+ ¡ Hg2+ ¡
Function of the mer Operon
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH PROBLEM ¡ SYSTEM
Hg2+ ¡ Hg2+ ¡
Function of the mer Operon
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH PROBLEM ¡ SYSTEM
Hg2+ ¡ Hg2+ ¡ Hg0 ¡
Function of the mer Operon
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH PROBLEM ¡ SYSTEM Hg2+ ¡
Hg2+ ¡
Function of the mer Operon
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH PROBLEM ¡ SYSTEM Hg2+ ¡
Hg2+ ¡ Hg2+ ¡
Function of the mer Operon
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH PROBLEM ¡ SYSTEM
Hg2+ ¡ Hg2+ ¡ Hg0 ¡
Function of the mer Operon
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH PROBLEM ¡ SYSTEM Hg2+ ¡
Maintaining Metabolic Activity
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH PROBLEM ¡ SYSTEM
Silica Sol-Tek Technology to Maximize Metal Reduction
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH PROBLEM ¡ SYSTEM Bacteria ¡ Silica ¡Nanopar)cle ¡ ¡ Solu)on ¡
Silica Sol-Tek Technology to Maximize Metal Reduction
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH PROBLEM ¡ SYSTEM Bacteria ¡ Silica ¡Nanopar)cle ¡ ¡ Solu)on ¡ Bacteria ¡in ¡ ¡ SNP ¡Sol ¡
Adjusts ¡pH ¡to ¡7 ¡ ¡ Mix ¡With ¡SNP ¡
TMOS ¡
Silica Sol-Tek Technology to Maximize Metal Reduction
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH PROBLEM ¡ SYSTEM Bacteria ¡ Silica ¡Nanopar)cle ¡ ¡ Solu)on ¡ Bacteria ¡in ¡ ¡ SNP ¡Sol ¡
Adjusts ¡pH ¡to ¡7 ¡ ¡ Mix ¡With ¡SNP ¡ Hydrolysis ¡
TMOS ¡
Silica Sol-Tek Technology to Maximize Metal Reduction
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH PROBLEM ¡ SYSTEM Bacteria ¡ Silica ¡Nanopar)cle ¡ ¡ Solu)on ¡ Bacteria ¡in ¡ ¡ SNP ¡Sol ¡
Adjusts ¡pH ¡to ¡7 ¡ ¡ Mix ¡With ¡SNP ¡
Stable ¡ Crosslinker ¡
Hydrolysis ¡
TMOS ¡ Encapsulated ¡ Bacteria ¡
Silica Sol-Tek Technology to Maximize Metal Reduction
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH PROBLEM ¡ SYSTEM Bacteria ¡ Silica ¡Nanopar)cle ¡ ¡ Solu)on ¡ Bacteria ¡in ¡ ¡ SNP ¡Sol ¡
Adjusts ¡pH ¡to ¡7 ¡ ¡ Mix ¡With ¡SNP ¡
Stable ¡ Crosslinker ¡
Cross ¡Linking ¡ Cross ¡Linking ¡ Hydrolysis ¡
TMOS ¡ Encapsulated ¡ Bacteria ¡
Silica Sol-Tek Technology to Maximize Metal Reduction
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH PROBLEM ¡ SYSTEM Bacteria ¡ Silica ¡Nanopar)cle ¡ ¡ Solu)on ¡ Bacteria ¡in ¡ ¡ SNP ¡Sol ¡
Adjusts ¡pH ¡to ¡7 ¡ ¡ Mix ¡With ¡SNP ¡
Stable ¡ Crosslinker ¡
Cross ¡Linking ¡ Cross ¡Linking ¡ Hydrolysis ¡
Evalua)on ¡ ¡
Utilizing Original UMN Silica Sol-Tek Technology to Maximize Metal Reduction
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH OVERVIEW ¡
Utilizing Original UMN Silica Sol-Tek Technology to Maximize Metal Reduction
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH OVERVIEW ¡
Utilizing Original UMN Silica Sol-Tek Technology to Maximize Metal Reduction
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH OVERVIEW ¡
Utilizing Original UMN Silica Sol-Tek Technology to Maximize Metal Reduction
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH OVERVIEW ¡
mer Operon Zone of Inhibition Testing – HgCl2
OVERVIEW ¡ SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH pDU1358 pBBRBB::mer pBBRBB::gfp (Vector control) pBBRBB::mer (no Hg)
mer Operon Zone of Inhibition Testing – HgCl2
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH OVERVIEW ¡
Cells Containing mer Operon Reduce Methylmercury
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH OVERVIEW ¡
Cells Containing mer Operon Reduce Methylmercury
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH OVERVIEW ¡
Methyl Mercury Methyl Mercury Ionic Mercury Volatile Mercury Volatile Mercury
Biochemical Network
MerB ¡ MerA ¡
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH OVERVIEW ¡ SYSTEM
Biochemical Network Model
MerB ¡ MerB ¡ MerA ¡ MerA ¡
Testable ¡Hypothesis: ¡MerA ¡is ¡rate-‑limi)ng ¡ SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH OVERVIEW ¡
User-friendly, Scalable Device
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH OVERVIEW ¡
FUNCTIONAL ¡
- Water ¡is ¡pumped ¡through ¡tubing ¡packed ¡with ¡
encapsulated ¡bacteria ¡ ¡
- Mercury ¡species ¡are ¡converted ¡to ¡Hg0 ¡
- Hg0 ¡is ¡adsorbed ¡onto ¡ac)vated ¡carbon ¡filter ¡
FUNCTIONAL ¡ ADAPTABLE ¡ SCALABLE ¡ INFORMED ¡
User-friendly, Scalable Device
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH OVERVIEW ¡
- Up: ¡800 ¡L ¡reactor ¡can ¡remediate ¡1 ¡mg/L ¡of ¡ ¡ ¡
CH3Hg+ ¡at ¡flow ¡rates ¡> ¡100 ¡L/hr ¡
- No ¡large ¡pressure ¡drops ¡or ¡fric)onal ¡losses ¡ ¡ ¡ ¡
across ¡column ¡
- Capacity ¡limited ¡only ¡by ¡life)me ¡of ¡bacteria ¡
- Down: ¡feasible ¡on ¡the ¡scale ¡of ¡domes)c ¡ ¡
water ¡soXener ¡filters ¡
FUNCTIONAL ¡ ADAPTABLE ¡ SCALABLE ¡ INFORMED ¡ SCALABLE ¡
User-friendly, Scalable Device
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH OVERVIEW ¡
- Deployed ¡a ¡Likert ¡scale ¡survey ¡of ¡five ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡
ques)ons ¡to ¡assess ¡public ¡percep)on ¡
- Added ¡extensive ¡mechanical ¡barriers ¡to ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡
prevent ¡leakage ¡
- Tested ¡leakage ¡from ¡cell ¡encapsulates ¡and ¡
designed ¡two ¡kill ¡switches ¡
FUNCTIONAL ¡ ADAPTABLE ¡ SCALABLE ¡ INFORMED ¡ INFORMED ¡
RBS ¡ Mod ¡lacp ¡ phsA ¡ phsB ¡ phsC ¡ E ¡ X ¡ S ¡ P ¡
Reducing More Heavy Metals
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH OVERVIEW ¡
- Improved ¡Yale ¡2010 ¡Part ¡(Bba_K393000) ¡by ¡adding ¡a ¡modified ¡lac ¡promoter ¡
- The ¡operon ¡no ¡longer ¡requires ¡IPTG ¡induc)on, ¡allowing ¡prac)cal ¡environmental ¡use ¡
- Improved ¡characteriza)on ¡by ¡tes)ng ¡it ¡with ¡cadmium ¡and ¡iron ¡ ¡
Function of PhsABC – Thiosulfate Reductase
Adapted ¡from ¡L. ¡Stoffels ¡et ¡al ¡(2011). ¡ ¡Journal ¡of ¡Bacteriology ¡ ¡
PhsA ¡ PhsC ¡ PhsB ¡ b ¡ b ¡ FeS ¡ FeS ¡ FeS ¡ FeS ¡ FeS ¡
Mo ¡ MKH2 ¡ MK ¡ 2 ¡H+ ¡ S2O3
2-‑ ¡ ¡+ ¡ ¡2 ¡H+ ¡
HS-‑ ¡ ¡+ ¡ ¡HSO3
- ‑ ¡
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH OVERVIEW ¡
Monitoring PhsABC Activity Using Cline’s Assay
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH OVERVIEW ¡
Precipita)on ¡of ¡Cadmium ¡as ¡CdS ¡ ¡
Visualizing Metal Precipitation From H2S
¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡pBBRBB::phsABC ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡pBBRBB::gfp ¡
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH OVERVIEW ¡
Precipita)on ¡of ¡Cadmium ¡as ¡CdS ¡ ¡
Visualizing Metal Precipitation From H2S
Precipita)on ¡of ¡Iron ¡as ¡FeS ¡
¡ ¡ ¡ ¡ ¡pBBRBB::phsABC ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡pBBRBB::gfp ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡pBBRBB::phsABC ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡pBBRBB::gfp ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡Abio,c ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡pBBRBB::phsABC ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡pBBRBB::gfp ¡
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH OVERVIEW ¡
By the People, For the People
Informing ¡ Our ¡Design ¡ Expert ¡ Insight ¡ Educa)onal ¡ Outreach ¡ Intellectual ¡ Property ¡
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH OVERVIEW ¡
The Great MN Get Together
- Address ¡Public ¡Investment ¡ ¡
- Acceptable ¡Applica)ons ¡
- Assess ¡Major ¡Concerns ¡
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH OVERVIEW ¡
Expert Insight
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH OVERVIEW ¡
Commitment to Service and Education
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH OVERVIEW ¡
+ ¡ = ¡
Securing Intellectual Property
- Ajended ¡ three ¡ IP ¡ Protec)on ¡ and ¡
Paten)ng ¡Workshops ¡
- Developed ¡a ¡business ¡plan ¡
- Economic ¡Analysis ¡ ¡
- Applied ¡for ¡paten)ng ¡through ¡OTC ¡
SYSTEM MODELING DEVICE BIOPRECIPITATION OUTREACH OVERVIEW ¡
Sponsors
Collaborators and Adivsors
Collaborators ¡ ¡
Summers ¡Lab ¡at ¡University ¡of ¡ Georgia ¡ Schmidt-‑Dannert ¡Lab ¡at ¡UMN ¡ Aksan ¡Lab ¡at ¡UMN ¡ Wackej ¡Lab ¡at ¡UMN ¡ Nater ¡Lab ¡at ¡UMN ¡ Colombia ¡iGEM ¡ Wisconsin ¡Lutheran ¡iGEM ¡
Advisors ¡
- Dr. ¡Jeffrey ¡Gralnick ¡
- Dr. ¡Casim ¡Sarkar ¡
Aunica ¡Kane ¡
- Dr. ¡Sarah ¡Purdue ¡
- Dr. ¡James ¡Ellinger ¡
- Dr. ¡Mark ¡Held ¡
Stephen ¡Heinsch ¡ Basem ¡Al-‑Shayeb ¡ Jessica ¡Tarnowski ¡ Suzie ¡Hsu ¡ Valeriu ¡Bortnov ¡ Cassandra ¡Barrej ¡ Niko ¡Le ¡Mieux ¡ Srijay ¡Rajan ¡ Taylor ¡Aldridge ¡ Patrick ¡Holec ¡ David ¡Hu ¡ Jennifer ¡Strommen ¡ Sarah ¡Lucas ¡ Logan ¡Pfaff ¡ Di ¡Liu ¡ Holly ¡Li ¡ Roxana ¡Karami ¡ Aaron ¡Free ¡ Tanner ¡Fuchs ¡ Camilo ¡Rey ¡Bedon ¡
The ¡Team ¡
Thank You!
Greenhouse Gas Emissions
Methane ¡is ¡produced ¡in ¡stoichiometric ¡amounts ¡ when ¡methylmercury ¡is ¡reduced ¡by ¡our ¡bacteria. ¡For ¡ a ¡1 ¡mg/L ¡concentra)on ¡(5 ¡μM) ¡of ¡methylmercury, ¡ ¡ 80 ¡μg ¡of ¡methane ¡will ¡be ¡produced ¡per ¡liter ¡of ¡water ¡
- remediated. ¡A ¡typical ¡cow ¡produces ¡180 ¡g ¡of ¡
methane ¡per ¡day, ¡meaning ¡over ¡2 ¡million ¡liters ¡of ¡ water ¡(enough ¡to ¡fill ¡a ¡747) ¡will ¡have ¡to ¡be ¡ remediated ¡per ¡day ¡to ¡match ¡the ¡methane ¡output ¡of ¡
- ne ¡cow. ¡
Moo! ¡