Abstract �������� ���������� ������� � ������� �������������������������������� ����� �������������������������������������� ��������������������������� ��������� ������������������������������������ ��������� � ������ ��������������������������������������� ����� ������������� ������������������� �������������������������������������� ������������������������������ �������������������������������� ��� ����!������!�"� ������� UseR Conference Vienna 14-17 June 2006 1 UseR Conference Vienna 14-17 June 2006 2 TraitMill: Greenhouse TraitMill: Plant imaging UseR Conference Vienna 14-17 June 2006 3 UseR Conference Vienna 14-17 June 2006 4
TraitMill: Seed processing Dataflows in TraitMill Field trials Vector Gene and construction promoter selection Crop transformation Lead identification LIMS Quality check by Q-PCR. Seed measurements Plant handling Seed counting Image analysis Plant imaging UseR Conference Vienna 14-17 June 2006 5 UseR Conference Vienna 14-17 June 2006 6 Screenshot Architecture of the LIMS (��������� !����������%�������� &���������������������� '������������������ &��������� ����� ���� ��� !"�"#������� ���� �%$ $��������������� $��������������� $������� ���#$� ������ UseR Conference Vienna 14-17 June 2006 7 UseR Conference Vienna 14-17 June 2006 8
Screenshot Architecture of the LIMS (��������� +��������� !����������%�������� &������������ &���������������������� ����������������� '������������������ &��������� ����� & ���� ��� !"�"#������� ���� �������� �%$ $��������������� $��������������� ���� ��� ,����� ����� !"�"#�������� $������� ���!�"#� ���#$� & �'��(� ������ ����) )����*������������� ������� ��������� UseR Conference Vienna 14-17 June 2006 9 UseR Conference Vienna 14-17 June 2006 10 Screenshot Methods used - ��� - ,�������������������� - �����./0 - ��������� - !������������������ - !1"" - ,������������������������ - ���� - ������� - "���������������� - �������� - 3��������� - ������� - ������� - '���������� - ������ - ,�����������4���������� - ������� - ������ - 2 � UseR Conference Vienna 14-17 June 2006 11 UseR Conference Vienna 14-17 June 2006 12
Decision support Main challenges - 5��� �������������� - !�����4�6������4����������������./����������6���70 - 5��������������� - 5��������������������7����.��������8�����������0 - �� ���������������������� - +������������ - *���� ��7�������� - "��������4�������� - ,�����������4���������� UseR Conference Vienna 14-17 June 2006 13 UseR Conference Vienna 14-17 June 2006 14 Arguments for choosing R Argument against choosing R � +������������������������������������������ ���� ������������������� � 9������������������������������������ � "����������������������������������%��� � )����%����������������������������������������� � <����������������!"�"#�������� � :������������������� � *���;������� ������������������ � 1����� ������������ UseR Conference Vienna 14-17 June 2006 15 UseR Conference Vienna 14-17 June 2006 16
Positive experience with R Negative experiences with R � ������������������������������������ � =�������������������������������7���� � &��������������������������������� � 1�������������������������� ��������� �������������������������������������� ���������4�� � *��%������������������������������� ��� � #���7����������������������������������� ���������������� ��������� � 5������������������������������������� � *����������� �� UseR Conference Vienna 14-17 June 2006 17 UseR Conference Vienna 14-17 June 2006 18 Conclusion ����������������� ������������ ����������������������������� 1�����>�������������������;���� ����������7������������������� ������� UseR Conference Vienna 14-17 June 2006 19
Recommend
More recommend