Abbrevia(ons in Swedish Clinical Text - use by three - - PowerPoint PPT Presentation

abbrevia ons in swedish clinical text use by three
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Abbrevia(ons in Swedish Clinical Text - use by three professions Elin LVESTAM a, , Sumithra VELUPILLAI b and Maria KVIST b, c a Dept. of Food, Nutrition and Dietetics, Uppsala university, Uppsala, Sweden b Dept.


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SLIDE 1

Elin LÖVESTAMa, , Sumithra VELUPILLAI b and Maria KVIST b, c

a Dept. of Food, Nutrition and Dietetics, Uppsala university, Uppsala, Sweden b Dept. of Computer and Systems Sciences, Stockholm University, Stockholm,

Sweden

c Dept. of Learning, Informatics, Management and Ethics (LIME), Karolinska

Institutet, Sweden

Abbrevia(ons ¡in ¡ ¡ Swedish ¡Clinical ¡Text ¡-­‑ ¡ ¡ use ¡by ¡three ¡professions ¡

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2

Abbrevia(ons ¡in ¡clinical ¡texts…

… ¡are ¡frequently ¡used … ¡can ¡be ¡standardized ¡or ¡ad ¡hoc … ¡are ¡o@en ¡ambiguous

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3

Unstandardized ¡and ¡ambiguous ¡ abbrevia(ons…

… ¡decreases ¡pa(ent ¡safety … ¡is ¡an ¡obstacle ¡for ¡pa(ents ¡reading ¡ther ¡own ¡EHR

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4

Aim

To ¡analyse ¡the ¡use ¡of ¡some ¡abbrevia(ons ¡by ¡three ¡professions:

  • Die((ans
  • Nurses
  • Physicians
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5

Two ¡different ¡corpora:

A. Diete(c ¡corpus ¡from ¡Uppsala:

  • 147 ¡systema(cally ¡collected ¡notes ¡by ¡die((ans
  • About ¡30 ¡000 ¡words

B. Subset ¡from ¡Stockholm ¡EPR ¡Corpus

  • Diete(c ¡notes ¡by ¡die((ans

¡9 ¡516 ¡625 ¡words

  • Daily ¡notes ¡by ¡nurses ¡

13 ¡925 ¡899 ¡ ¡words

  • Radiology ¡notes ¡by ¡physicians ¡

15 ¡370 ¡134 ¡words

A B

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SLIDE 6

6

Extrac(ng ¡and ¡matching ¡abbrevia(ons

  • 1. ¡Corpus ¡A
  • Manual ¡content ¡

analysis

  • Result: ¡266 ¡unique ¡

abbrevia(ons

  • 2. ¡Corpus ¡B
  • Tokenized ¡
  • Matched ¡with ¡the ¡

¡ ¡ ¡ ¡266 ¡abbrevia(ons

A B

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SLIDE 7

7

Context ¡analysis

  • 1. ¡Corpus ¡A
  • 40 ¡abbrevia(ons ¡

were ¡selected

  • 2. ¡Corpus ¡B
  • 20 ¡sentences ¡randomly ¡

extracted ¡for ¡each ¡ ¡ abbrevia(on

A B

  • Classification

in categories

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8

72 ¡ ¡% %

(n=191)

3 ¡ ¡% %

(n=9)

5 ¡ ¡% %

(n=12)

3 ¡ ¡% %

(n=7)

8 ¡ ¡% %

(n=21)

0 ¡ ¡% %

(n=0)

1 ¡ ¡% %

(n=2)

None: ¡9 ¡

¡% %

(n=24)

Results

Frequencies ¡of ¡shared ¡abbrevia(ons ¡(n=266)

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SLIDE 9

Ca Categ egor

  • ries

es

Cor Corpus ¡A ¡A (n=2 =266) General ¡non-­‑standardized 90 General ¡standardized 12 General ¡standardized, ¡ punctua(on ¡mistakes 25 Food/meals 36 Medical ¡assessment ¡and ¡ interven(on 33 Diseases 18 Units 17 Ins(tu(ons/hospitals 16 Laboratory ¡values 16 Health ¡care ¡professions 5 Body ¡parts Names ¡of ¡persons/products Probable ¡spelling ¡mistakes 3

Categoriza(on ¡of ¡abbrevia(ons ¡found ¡in ¡corpus ¡A

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SLIDE 10

Categoriza(on ¡of ¡the ¡40 ¡abbrevia(ons ¡in ¡corpus ¡B

5 10 15 20 25 30 Probable spelling mistakes Names of persons/products Body parts Health care professions Laboratory values Institutions/hospitals Units Diseases Medical assessment/ intervention Food/meals General standardized, punctuation mistakes General standardized General non-standardized

Dietitians (n=40) Nurses (n=40) Physicians (n=40)

General non-standardized General standardized General standardized, punctuation mistakes Food/meals Medical assessment/intervention Diseases Units Institutions/hospitals Laboratory values Health care professsions Body parts Names of persons/products Probable spelling mistakes

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SLIDE 11

Mul(ple ¡meanings ¡of ¡abbrevia(ons ¡found ¡in ¡corpus ¡B

5 10 15 20 25 30 1 2 3 4 5 6 7 Dietitians Nurses Physicians Number of meanings/abbreviation Number of abbreviations

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SLIDE 12

Different ¡meanings ¡of ¡the ¡ ¡ abbrevia(on ¡”gr”in ¡Corpus ¡B

Used Used ¡b ¡by ¡p y ¡prof

  • fession

ession Or Original ¡e ¡exp xpres ession

  • n

Or Original ¡e ¡exp xpres ession

  • n ¡i

¡in ¡ ¡ Sw Swedish Die((an ¡+ ¡nurse ¡+ ¡ physician gram gram Nurse ¡+ ¡physician Celsius ¡degree grader Die((an ¡+ ¡physician group grupp Die((an ¡+ ¡nurse (mes gånger Physician angular ¡degree grader Physician level ¡of ¡disease grad ¡av ¡sjukdom Physician due ¡to på ¡grund ¡av ¡( ¡p ¡gr ¡a) Nurse probable ¡spelling ¡ mistake

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SLIDE 13

Different ¡ways ¡to ¡abbreviate ¡ ¡ diabetes ¡mellitus ¡in ¡Corpus ¡B

Ab Abbrevia(on

  • n

Or Original ¡ ¡ ex expre ression Die((ans Die((ans Nu Nurses es Ph Physic sicians ians diab diabetes 118 965 158 dm diabetes ¡mellitus 432 38 290 DM Diabetes ¡Mellitus 597 69 4219 DMT1 Diabetes ¡Mellitus ¡ type ¡1 71 DMT2 Diabetes ¡Mellitus ¡ type ¡2 39 IDDM Insulin ¡Dependent ¡ Diabetes ¡Mellitus 416 36

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  • Ambiguous ¡abbrevia(ons ¡are ¡common ¡both ¡within ¡and ¡between ¡

professions

  • Different ¡professions ¡seem ¡to ¡have ¡different ¡abbrevia(on ¡

cultures

Conclusions

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SLIDE 15

This ¡may ¡lead ¡to…

  • …misunderstandings ¡between ¡healthcare ¡professionals
  • …misunderstandings ¡between ¡healthcare ¡professionals ¡and ¡

pa(ents ¡reading ¡their ¡own ¡pa(ent ¡record

  • …difficul(es ¡performing ¡automated ¡informa(on ¡extrac(on ¡

from ¡pa(ent ¡records

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Corresponding ¡author: ¡Elin ¡Lövestam, ¡ elin.lovestam@ikv.uu.se