atlas update i o developments
play

ATLAS Update : I/O Developments Peter van Gemmeren (ANL) ROOT - PowerPoint PPT Presentation

ATLAS Update : I/O Developments Peter van Gemmeren (ANL) ROOT I/O Workshop, #3 ATLAS use of ROOT TTreeCache ATLAS stores most of its data in ROOT TTrees. RDO, ESD,


  1. ATLAS Update : I/O Developments Peter ¡van ¡Gemmeren ¡(ANL) ¡ ROOT ¡I/O ¡Workshop, ¡#3 ¡

  2. ATLAS use of ROOT TTreeCache  ATLAS ¡stores ¡most ¡of ¡its ¡data ¡in ¡ROOT ¡TTrees. ¡ – RDO, ¡ESD, ¡AOD ¡and ¡(POOL’ esque ) ¡DPD ¡have ¡a ¡ TBranch ¡per ¡collec7on ¡ (configurable), ¡which ¡are ¡read ¡separately ¡on ¡demand. ¡ • Several ¡ hundreds ¡of ¡disk-­‑reads , ¡not ¡ordered. ¡ – D3PD ¡stores ¡ a=ributes ¡in ¡TBranches. ¡ • Many ¡ thousand ¡branches , ¡but ¡only ¡a ¡(small) ¡subset ¡is ¡needed ¡by ¡each ¡ individual ¡analysis. ¡  TTreeCache ¡opMmizes ¡read ¡performance ¡of ¡a ¡TTree ¡by ¡ minimizing ¡the ¡number ¡ of ¡and ¡ ordering ¡disk ¡reads : ¡ – In ¡a ¡‘ learning ¡phase ’ ¡it ¡discovers ¡the ¡TBranches ¡that ¡are ¡needed. ¡ – ARer ¡that, ¡a ¡read ¡on ¡any ¡TBranch ¡will ¡also ¡read ¡the ¡rest ¡of ¡the ¡ TBranches ¡in ¡the ¡cache ¡with ¡a ¡ single ¡read . ¡ Peter ¡van ¡Gemmeren ¡(ANL): ¡"Atlas ¡Update: ¡I/O ¡Developments" ¡ 2 ¡ 03/22/2012 ¡

  3. TTreeCache Performance  ROOT ¡TTreeCache ¡can ¡have ¡a ¡ huge ¡impact ¡ on ¡read ¡ performance: ¡ – Reduce ¡number ¡of ¡disk-­‑reads ¡by ¡ several ¡order ¡of ¡magnitudes ¡ • Impact ¡depends ¡on ¡system ¡setup ¡and ¡use ¡case. ¡ – Details ¡from ¡IlijaV ¡presentaMons. ¡  However, ¡there ¡are ¡restricMons ¡in ¡the ¡usability ¡of ¡TTreeCache: ¡ – Performance ¡Repor7ng ¡ not ¡as ¡detailed ¡and ¡reliable ¡as ¡one ¡could ¡wish. ¡ • Should ¡improve ¡somewhat ¡in ¡next ¡releases. ¡ – Only ¡ one ¡automa7c ¡TTreeCache ¡ per ¡TFile. ¡ – Slow ¡learning ¡ phase. ¡ • No ¡caching ¡while ¡learning. ¡ Peter ¡van ¡Gemmeren ¡(ANL): ¡"Atlas ¡Update: ¡I/O ¡Developments" ¡ 3 ¡ 03/22/2012 ¡

  4. ATLAS use case for multiple TTreeCaches  ATLAS ¡uses ¡ several ¡TTrees ¡per ¡file : ¡ – Partly ¡due ¡to ¡ROOT ¡restricMon ¡that ¡all ¡TBaskets ¡need ¡to ¡be ¡in ¡sync. ¡ • ATLAS ¡does ¡have ¡objects ¡that ¡do ¡not ¡belong ¡into ¡a ¡collecMon ¡and ¡vary ¡in ¡ number ¡by ¡event ¡(e.g.: ¡conversion ¡helper ¡objects). ¡ – Payload ¡data ¡and ¡references. ¡ – Main ¡event ¡tree ¡holds ¡ ~90% ¡of ¡baskets ¡ (ESD/AOD). ¡  ATLAS ¡cannot ¡‘manually’ ¡create ¡addiMonal ¡TTreeCache. ¡ – Athena ¡I/O ¡is ¡ROOT ¡unaware, ¡uses ¡ROOT ¡via ¡POOL ¡(or ¡its ¡successor). ¡ • For ¡beaer ¡or ¡worse, ¡ATLAS ¡has ¡resisted ¡making ¡its ¡objects ¡inherit ¡from ¡ TObject ¡to ¡avoid ¡dependency. ¡  ROOT ¡being ¡able ¡to ¡use ¡caches ¡for ¡all ¡the ¡trees, ¡should ¡help ¡ ATLAS ¡to ¡lower ¡ disk-­‑reads ¡by ¡an ¡order ¡of ¡magnitude . ¡ Peter ¡van ¡Gemmeren ¡(ANL): ¡"Atlas ¡Update: ¡I/O ¡Developments" ¡ 4 ¡ 03/22/2012 ¡

  5. TMemFile for output  TMemFile, ¡ROOT ¡way ¡of ¡combining/merging ¡several ¡TTrees ¡to ¡ the ¡same ¡output ¡TTree. ¡  With ¡the ¡migraMon ¡away ¡from ¡POOL ¡and ¡potenMally ¡closer ¡to ¡ ROOT, ¡ATLAS ¡may ¡decide ¡to ¡leverage ¡these ¡features ¡directly. ¡  However, ¡there ¡sMll ¡are ¡open ¡quesMons: ¡ – Biggest ¡obstacle ¡for ¡ATLAS: ¡InserMng ¡TTree ¡entry ¡in ¡TMemFile ¡will ¡not ¡ return ¡valid ¡entry ¡number ¡(afaik), ¡so ¡we ¡cannot ¡easily ¡create ¡an ¡ external ¡token ¡ – Not ¡clear ¡whether ¡type ¡specific ¡funcMon ¡calls ¡could ¡be ¡sufficient ¡to ¡ merge ¡metadata ¡objects ¡ – And ¡what ¡about ¡mulMple ¡ tree ¡synchroniza7on ? ¡ Peter ¡van ¡Gemmeren ¡(ANL): ¡"Atlas ¡Update: ¡I/O ¡Developments" ¡ 5 ¡ 03/22/2012 ¡

  6. TMemFile and ATLAS references  ATLAS ¡uses ¡ externalize-­‑able ¡references ¡ for ¡navigaMon. ¡ – Flat ¡Data ¡Model, ¡DataHeader ¡stores ¡‘ tokens ’ ¡to ¡all ¡container ¡of ¡each ¡ event: ¡ • Intra-­‑ ¡and ¡Inter-­‑ ¡file ¡references ¡ • Across ¡different ¡representaMon ¡(e.g.: ¡AOD ¡to ¡ESD) ¡ • Different ¡TTree/TBranch ¡entry ¡numbers ¡(event ¡to ¡helper ¡object) ¡  Token ¡store ¡ file ¡id ¡ (POOL ¡Guid) ¡and ¡ TTree/TBranch ¡entry ¡ numbers . ¡  ARer ¡wriMng ¡an ¡event/entry, ¡TMemFile ¡does ¡not ¡have ¡ final ¡ entry ¡number . ¡ Peter ¡van ¡Gemmeren ¡(ANL): ¡"Atlas ¡Update: ¡I/O ¡Developments" ¡ 6 ¡ 03/22/2012 ¡

  7. Plans and outlook  TTreeCache ¡Plans: ¡ – TTreeCache ¡learning ¡phase ¡improvements: ¡ • Cache ¡during ¡learning ¡ – Useful ¡if ¡basket ¡size ¡is ¡small ¡compared ¡to ¡learning ¡phase. ¡ » ATLAS ¡uses ¡small ¡5/10 ¡event ¡baskets ¡for ¡ESD/AOD ¡ • Minimize ¡effects ¡of ¡misuse: ¡ – E.G., ¡in ¡ATLAS ¡analysis ¡some ¡use ¡TTreeCache, ¡but ¡do ¡tree-­‑>GetEntry() ¡without ¡ telling ¡the ¡cache ¡to ¡store ¡all ¡branches. ¡  TMemFile ¡Outlook: ¡ – InvesMgate ¡references ¡when ¡using ¡TMemFile ¡. ¡ • Implement ¡de-­‑referencing ¡layer ¡in ¡ROOT? ¡ – Similar ¡to ¡POOL’s ¡‘##SecMons’ ¡table ¡ Peter ¡van ¡Gemmeren ¡(ANL): ¡"Atlas ¡Update: ¡I/O ¡Developments" ¡ 7 ¡ 03/22/2012 ¡

Download Presentation
Download Policy: The content available on the website is offered to you 'AS IS' for your personal information and use only. It cannot be commercialized, licensed, or distributed on other websites without prior consent from the author. To download a presentation, simply click this link. If you encounter any difficulties during the download process, it's possible that the publisher has removed the file from their server.

Recommend


More recommend